ChemOffice软件的操作和使用.pptVIP

第二章 化学编辑排版和分子模拟计算;第二章 化学编辑排版和分子模拟计算; 第二部分 ChemOffice 软件的使用 ;主要内容;2.1 简介;;包含三大模块;2.2 ChemDraw的使用;ChemDraw可在Win9X/Win2000/WinXP下运行。双击 ，程序打开后，窗口主界面与一般Windows软件相似，依 次为菜单栏、工具栏和文档区以及状态栏，工具栏提供 了很多常用的化学分子及化学键。 使用时只用鼠标点一下工具栏中所需工具，移动鼠标到 编辑区后，鼠标指针变为“+”，再在文档区的合适位置点击 鼠标，则分子结构式就会出现，使用十分方便 支持Windows剪贴板，所有结构式可以方便地剪贴到 Word文档中，而当要修改时，只需在Word文档中双击结 构式，即可打开ChemDraw进行修改。;结构工具栏;*;模 板;绘图实例; 图形的旋转与缩放 检查结构错误和整理结构式 根据化合物名称得到结构式 根据结构得出化合物命名 预测核磁共振化学位移 分子结构估计性质 元素周期表 符号、字体和颜色 快捷菜单和快捷键 绘制化学反应式 绘制实验装置;2.2.2 结构绘制功能;1. Fischer（费舍尔）投影式;2. Haworth（霍沃思）投影式;3. Newman（纽曼）投影式;4. 立体化学;2.2.3 ChemNMR-核磁谱的计算;;;;;2.2.4 ChemProp—— 分子物理化学性质计算和标准命名;ChemDraw绘制轨道的方法是使用轨道绘制工具箱，这个工具箱能够绘制s轨道、σ轨道、单瓣轨道、p轨道、杂化轨道、d轨道和dz2轨道。每种轨道都包括有三种填充类型：背景色、阴影和纯色，具体的颜色则可以自己设置。下图是一个例子：;2. 3 Chem3D的使用;Chem3D中α-D-葡萄糖的显示效果图;线状模型 棒状模型 球棍模型 圆柱键模型 比例模型;ChemDraw结构式与3D模型间的转换;以乙烯为例，首先使用文本输入工具输入分子式CH 2CH 2，则会自动生成3D的乙烯分子，然后使用Analyze菜单的Extended Huckel Surfaces功能，再使用View菜单的Molecular Orbitals（显示各种分子轨道），出现对话框后可以选择显示HOMO还是LUMO，根据参数的不同产生的轨道形状不同，还可以选择不同的表面显示效果。;整理结构与简单优化;显示3D模型信息;;下图是选择LUMO（N=7）的显示效果;2. 4 ChemFinder的使用;2.4.2 根据结构式检索;根据分子式检索;输入C5-6N2，按回车键;;根据化学名称检索;单击 按钮逐项查看，可显示大名鼎鼎的尼古丁分子，其貌不扬但危害巨大。;输入“160-170”，按回车键;使用化学反应数据库;查找免费网络资源;;检索举例：C6H6（苯）;参考文献;作业;3. 画出1个实验蒸馏装置 4. 制作苯环分子的立体结构图，并进行分子几何的优化计算 5. 绘制N-甲基苯甲酰胺和苯乙酮的结构式，用表格列出其物理化学性质，并预测苯乙酮的质子和13C的化学位移;