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牡丹论文：牡丹EST-SSR引物开发及其亲缘关系分析 【中文摘要】牡丹(Paeonia suffruticosa Andrews.)花大形美,色艳香浓,不仅具有很高的观赏价值,而且还有极高的药用价值。其种质资源极为丰富,种质资源的保存和评价是其利用的重要前提,其分子水平上的遗传多样性研究已取得了较大进展。但是,在揭示种间、种内及品种群间遗传关系和栽培牡丹起源问题上并未取得一致性结论。因此,开发适用于牡丹的EST-SSR标记应用于牡丹遗传图谱的构建、物种间亲缘关系鉴定、辅助育种等方面具有重要意义。利用公共数据库中数量增加的表达序列标签(expressed sequence tag, EST)资源来开发微卫星分子标记(Simple Sequence Repeat,SSR)已广泛地应用在许多动植物的基因组分析。EST-SSR是通过对EST序列进行分析,找到含有重复单元的位置,在两侧设计引物而开发得到的,因此,EST-SSR反映基因的编码部分,可直接获得基因的表达信息,并可对一些重要性状进行直接鉴定。本研究利用NCBI数据库中牡丹EST序列信息,在了解牡丹EST的SSR信息的基础上,首次建立了牡丹EST-SSR标记,同时利用筛选出的29对引物对55份牡丹品种亲缘关系... 【英文摘要】Tree peonies are famous ornamental flowers all over the world because its flower is large, bright-colored and strong fragrance. They are not only have high ornamental value, but also a high medicine value. There are so many cultivarsand the germplasm resources are very abundant. The conservation and use of evaluation is an important prerequisite for use. The genetic relationship at the molecular level research has made great progress. However, in revealing the genetic relationships of interspecific species ... 【关键词】牡丹 EST-SSR引物 聚类分析 亲缘关系 【英文关键词】Tree Peony EST-SSR primer Cluster analysis Genetic relationship 【索购全文】联系Q1：138113721 Q2：139938848 【目录】牡丹EST-SSR引物开发及其亲缘关系分析 摘要 2-4 ABSTRACT 4-5 符号表 6-9 第1章 文献综述 9-23 1.1 牡丹概述 9 1.2 分子标记概述 9-13 1.2.1 RFLP 标记 10-11 1.2.2 RAPD 标记 11 1.2.3 AFLP 标记 11 1.2.4 SNP 标记 11-12 1.2.5 ISSR 标记 12 1.2.6 SSR 标记 12-13 1.3 SSR 分子标记研究发展 13 1.4 EST-SSR 分子标记的研究发展 13-20 1.4.1 EST 分子标记的类型 14-15 1.4.2 EST 分子标记的特点 15 1.4.3 EST 分子标记的开发策略 15-17 1.4.4 EST-SSR 的频率及特点 17 1.4.5 EST-SSR 标记在植物比较基因组学上的应用 17-19 1.4.6 EST-SSR 标记在基因功能上的应用 19 1.4.7 EST-SSR 标记的发展趋势及前景 19-20 1.5 本文的研究内容与意义 20-23 1.5.1 选题的依据 20-21 1.5.2 研究的目的及意义 21-22 1.5.3 研究的技术路线 22-23 第2章 牡丹 EST 资源的 SSR 信息分析及引物开发 23-31 2.1 材料与方法 23-24 2.1.1 牡丹EST 序列的来源 23-24 2.1.2 牡丹EST 序列的前期处理 24 2.1.3 SSR 位点的筛选 24 2.1.4 牡丹EST-SSR 引物开发 24 2.2 结果与分析 24-28 2.2.1 牡丹EST-SSR 的发掘 24 2.2.2 牡丹EST-SSR 的频率和分布密度 24-25 2.2.3