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第30卷第10期 东北大学学报( 自然科学版) VoI.30.No.10
9
2009年10月 ofNonheaStem 0ct. 200
Joumal University(NaturalScience)
基于ELM的蛋白质二级结构预测及其后处理
赵相国。王国仁
(东北大学信息科学与工程学院.辽宁沈阳 110004)
摘 要:将ELM应用到蛋白质二级结构模型的训练中,在此基础上提出了基于概率的合并算法
了预测结果的Helix一后处理(HeIix—post-prl。cessing,卜Ⅱ)P)算法,对合并后的预测结果进行有效的后处理,从而
进一步提高预测结果的准确率.分别在CB513和RSl26两个数据集上进行r实验,实验结果表明,预测结果
的准确率是令人满意的,尤其是实现r训练时间上的显著缩短.
关键词:蛋白质二级结构预测;ELM;基于概率的合并算法;H“x一后处理算法
中图分类号:TP311.13 文献标识码:A 文章编号:1005—3026(2009)10—1402—04
BasedonExtreme Machine
APredictionFramework Learnin2
forSecondarvStructureofProtein
Z}执0
X缸咒g-g“D,WrA』、以G“㈣州
(sch础ofInf()mlation蹦ence “0004,Chilla.
Enginee^ng,Nonheast锄UniverSity,Shenyang
C()n笛pondellt:ZHAoXiang-guo,E-mail:zhaoxianggI的@mail.neu.edu.cn)
Abstract:A frame、vorkwas for the structurem()delof
prediction propOSedtrainingsecondary
on theextreme machine
baseda neweffective i.e.,
protein, leamingalgorithm, leaming
the r器ults
(ELM).Then,to togetherbetter,aprobability.basedcombining
mergepredicted
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(PBC)aIgo^thm HeIix—post.proceSsing(肝P)aIgorithmac∞rding
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