基于ELM的蛋白质二级结构预测及其后处理.pdf

第30卷第10期 东北大学学报( 自然科学版) VoI．30．No．10 9 2009年10月 ofNonheaStem 0ct． 200 Joumal University(NaturalScience) 基于ELM的蛋白质二级结构预测及其后处理 赵相国。王国仁 (东北大学信息科学与工程学院．辽宁沈阳 110004) 摘 要：将ELM应用到蛋白质二级结构模型的训练中，在此基础上提出了基于概率的合并算法 了预测结果的Helix一后处理(HeIix—post-prl。cessing，卜Ⅱ)P)算法，对合并后的预测结果进行有效的后处理，从而 进一步提高预测结果的准确率．分别在CB513和RSl26两个数据集上进行r实验，实验结果表明，预测结果 的准确率是令人满意的，尤其是实现r训练时间上的显著缩短． 关键词：蛋白质二级结构预测；ELM；基于概率的合并算法；H“x一后处理算法 中图分类号：TP311．13 文献标识码：A 文章编号：1005—3026(2009)10—1402—04 BasedonExtreme Machine APredictionFramework Learnin2 forSecondarvStructureofProtein Z}执0 X缸咒g-g“D，WrA』、以G“㈣州 (sch础ofInf()mlation蹦ence “0004，Chilla． Enginee^ng，Nonheast锄UniverSity，Shenyang C()n笛pondellt：ZHAoXiang-guo，E-mail：zhaoxianggI的@mail．neu．edu．cn) Abstract：A frame、vorkwas for the structurem()delof prediction propOSedtrainingsecondary on theextreme machine baseda neweffective i．e．， protein， leamingalgorithm， leaming the r器ults (ELM)．Then，to togetherbetter，aprobability．basedcombining mergepredicted waS witha Setout (PBC)aIgo^thm HeIix—post．proceSsing(肝P)aIgorithmac∞rding prop0睫d to the featuresof structure，whichwill efficient biological protein’sSecondary provide pC哦一 effecton resultsafter soasto their further． the proceSsing predicted merging imp砌ve accuracy The