一种扩展的Post类函数及其对基因调控机制的影响.pdfVIP

第 ７ 期 电 子 学 报 Ｖｏｌ．４４ Ｎｏ．７ ２０１６ 年 ７ 月 ＡＣＴＡ ＥＬＥＣＴＲＯＮＩＣＡ ＳＩＮＩＣＡ Ｊｕｌ． ２０１６ 一种扩展的 Ｐｏｓｔ 类函数及其对基因 调控机制的影响 许 鹏１ ，欧阳宏嘉１ ，沈良忠２ ，刘文斌１ （１．温州大学物理与电子信息工程学院，浙江温州 ３２５０３５；２．温州大学城市学院，浙江温州 ３２５０３５） 摘 要： 已有的理论分析表明，有序函数对网络的运行及其动态行为具有重要的影响．Ｐｏｓｔ 类函数是目前发现 的数量最大的一种???序函数，其缺点是它仅反映了基因之间的正调控机制．本文在 Ｐｏｓｔ 类函数的基础上，将其扩展为 一种同时具有正负调控机制的函数类．仿真结果表明：扩展的 Ｐｏｓｔ 类函数在维持网络的有序性及长程相关性方面，和 原有的 Ｐｏｓｔ 类函数以及渠化函数类似．同时与已有的 Ｐｏｓｔ 类和渠化函数相比，新扩展的 Ｐｏｓｔ 类函数量最多．从进化的 角度，新扩展的函数更有可能成为自然进化选择的调控方式．通过对八种真实生物系统布尔网络模型函数分布的研 究，也部分的支持这一结论． 关键词： 布尔网络；动态行为；Ｐｏｓｔ 类函数；基因调控网络 中图分类号： ＴＰ３９１ 文献标识码： Ａ 文章编号： ０３７２-２１ １２ （２０１６）０７-１６８９-０５ 电子学报 ＵＲＬ：ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｅｊｏｕｒｎａｌ．ｏｒｇ．ｃｎ ＤＯＩ：１０．３９６９ ／ｊ．ｉｓｓｎ．０３７２-２１ １２．２０１６．０７．０２４ Ｔｈｅ Ｓｔｕｄｙ ｏｆ ａｎ Ｅｘｔｅｎｄｅｄ Ｐｏｓｔ ＣＩａｓｓ Ｆｕｎｃｔｉｏｎｓ ａｎｄ ｉｔｓ ＩｎｆＩｕｅｎｃｅ ｏｎ ｔｈｅ Ｇｅｎｅ ＲｅｇｕＩａｔｏｒｙ Ｍｅｃｈａｎｉｓ ｍ ＸＵ Ｐｅｎｇ１ ，ＯＵＹＡＮＧ Ｈｏｎｇ-ｊｉａ１ ，ＳＨＥＮ Ｌｉａｎｇ-ｚｈｏｎｇ２ ，ＬＩＵ Ｗｅｎ-ｂｉｎ１ （１．Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆＰｈｙｓｉｃｓ ａｎｄ Ｅｌｅｃｔｒｏｎｉｃ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，Ｗｅｎｚｈｏｕ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｗｅｎｚｈｏｕ，Ｚｈｅｊｉａｎｇ ３２５０３５，Ｃｈｉｎａ； ２．Ｃｉｔｙ Ｃｏｌｌｅｇｅ，Ｗｅｎｚｈｏｕ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｗｅｎｚｈｏｕ，Ｚｈｅｊｉａｎｇ ３２５０３５，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ： Ｔｈｅｏｒｅｔｉｃａｌ ａｎａｌｙｓｉｓ ｒｅｖｅａｌｓ ｔｈａｔ ｏｒｄｅｒｅｄ ｆｕｎｃｔｉｏｎｓ ｐｌａｙ ａｎ ｉｍｐｏｒｔａｎｔ ｒｏｌｅ ｉｎ ｔｈｅ ｒｕｎｎｉｎｇ ａｎｄ ｄｙｎａｍｉｃａｌ ｂｅ- ｈａｖｉｏｒ ｏｆ ｎｅｔｗｏｒｋｓ．Ｐｏｓｔ ｆｕｎｃｔｉｏｎ ｃｌａｓｓ ｈａｓ ｂｅｅｎ ｋｎｏｗｎ ａｓ ｔｈｅ ｍａｘｉｍａｌ ｏｒｄｅｒｅｄ ｆｕｎｃｔｉｏｎ．Ｈｏｗｅｖｅｒ，ｉｔ ｏｎｌｙ ｄｅｓｃｒｉｂｅｓ ｔｈｅ ｐｏ