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江苏农业科学　２０１６年第４４卷第２期 — １３ — 韩俊杰，王昊龙，李卫华．关联分析及其在不同分子标记中的应用综述［Ｊ］．江苏农业科学，２０１６，４４（２）：１３ －１７． ｄｏｉ：１０．１５８８９／ｊ．ｉｓｓｎ．１００２ －１３０２．２０１６．０２．００４ 关联分析及其在不同分子标记中的应用综述 韩俊杰，王昊龙，李卫华 （石河子大学农学院／新疆生产建设兵团绿洲生态农业重点实验室，新疆石河子８３２００３） 　　摘要：关联分析技术在植物中的应用较晚，近些年才在植物数量性状和植物遗传育种研究中得以应用。关联分析 以连锁不平衡作图（ＬＤ ｍａｐｐｉｎｇ）为基础，用来鉴定植物性状与目标基因之间的关系。关联分析有很明显的应用优势， 它不仅不需要特殊的构图群体，而且还能够同时对多个基因位点进行检测，精度非常高。由于其良好的实用性，关联 分析技术已经成为国际基因组学的研究热点。介绍了ＬＤ 的定义和度量方法，综述了基于分子标记的关联分析在植 物遗传中的应用，并对其在遗传学中的应用和发展作了展望。 　　关键词：植物；分子标记；关联分析；连锁不平衡；遗传学；应用 　　中图分类号：Ｑ７８　　文献标志码：Ａ　　文章编号：１００２－１３０２（２０１６）０２－００１３ －０５ 　　关联分析又称连锁不平衡作图（ｌｉｎｋａｇｅ ｄｉｓｅｑｕｉｌｉｂｒｉｕｍ 进了基因组学的发展，特别是近年来大量单核苷酸多态性 ｍａｐｐｉｎｇ，ＬＤ ｍａｐｐｉｎｇ），是建立在连锁不平衡的基础上用于鉴 （ｓｉｎｇｌｅ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓ，ＳＮＰ）标记的开发，关联分析 ［１］ 定群体内目标性状与遗传标记相关关系的方法 。关联分 在植物关键基因的发掘上更是得到了广泛的应用，可为植物 析最早在人类疾病的研究中得以应用，并取得了丰硕的成果， 分子育种提供标记，在国际上已经成为热点研究方向。 ［２］ 目前在人类不同致病基因方面已有许多成功的报道 。在 关联分析通过群体上的进化历史和重组，可以在序列水 动物中的应用也相对较多，如在奶牛、鱼、羊、猪、鸡中的应用 平上来研究复杂的数量性状，因此与其他分析手段相比，关联 等。然而，由于目前对植物基因组 ＬＤ结构的认识还不够全 分析有其独特的优势：（１）所需时间短，用自然群体作为材 ［３］ 面，导致关联分析在植物中的应用相对较少 。但是，随着 料，不需要专门构建，且有较大的选择范围，相对于数量性状 生物信息学、统计学和基因组学技术的快速发展，关联分析也 基因座（ＱＴＬ）至少需要２ 年以上的群体能节约大量的时间； 已成功应用到许多植物上，如玉米、小麦、拟南芥、大麦、大豆 （２）检测范围大，同一座位的不同基因可以用来同时检测，而 等。近年来，许多植物的全基因组测序已经完成，这极大地促 ＱＴＬ作图只能检测来自双亲的２个等位基因；（３）准确度高， ＱＴＬ作图精度一般在 １０ ～３０ｃＭ左右，很少能在基因水平上 收稿日期：２０１５ －０１ －０５ 被标记，而关联分析可达到单基因的水平［４－５］，如Ｇｅｂｈａｒｄｔ等 基金项目：国家自然科学基金（编号。 利用关联分析方法将马铃薯抗晚瘟病基因ＲＩ定位在０．２ｃＭ 作者简介：韩俊杰（１９８９—），男，河