中科曙光基因数据与存储平台方案范例.docx

基因数据分析与存储平台 建设方案  目录  TOC \o 1-3 \h \z \u  HYPERLINK \l _Toc430713748 1 平台建设需求分析  PAGEREF _Toc430713748 \h 3  HYPERLINK \l _Toc430713749 1.1 平台组成  PAGEREF _Toc430713749 \h 3  HYPERLINK \l _Toc430713750 1.2 系统应用分析  PAGEREF _Toc430713750 \h 4  HYPERLINK \l _Toc430713751 2 系统方案设计  PAGEREF _Toc430713751 \h 7  HYPERLINK \l _Toc430713752 2.1 系统配置表  PAGEREF _Toc430713752 \h 7  HYPERLINK \l _Toc430713753 2.2 系统拓扑图  PAGEREF _Toc430713753 \h 10  HYPERLINK \l _Toc430713754 2.3 系统方案说明  PAGEREF _Toc430713754 \h 11  HYPERLINK \l _Toc430713755 3 系统技术参数  PAGEREF _Toc430713755 \h 12  HYPERLINK \l _Toc430713756 3.1 总体指标  PAGEREF _Toc430713756 \h 12  HYPERLINK \l _Toc430713757 3.2 刀片机箱  PAGEREF _Toc430713757 \h 12  HYPERLINK \l _Toc430713758 3.3 计算刀片  PAGEREF _Toc430713758 \h 12  HYPERLINK \l _Toc430713759 3.4 四路节点  PAGEREF _Toc430713759 \h 12  HYPERLINK \l _Toc430713760 3.5 管理登录节点  PAGEREF _Toc430713760 \h 12  HYPERLINK \l _Toc430713761 3.6 存储节点  PAGEREF _Toc430713761 \h 13  HYPERLINK \l _Toc430713762 3.7 集群网络  PAGEREF _Toc430713762 \h 13  HYPERLINK \l _Toc430713763 3.8 机柜配电  PAGEREF _Toc430713763 \h 13  HYPERLINK \l _Toc430713764 3.9 集群软件  PAGEREF _Toc430713764 \h 13  HYPERLINK \l _Toc430713765 3.10 系统集成实施与售后服务  PAGEREF _Toc430713765 \h 15   平台建设需求分析 平台组成 生物信息学研究平台可分为测序平台和分析平台两部分，测序平台以基因测序仪为核心，完成基因测序，获得原始数据；分析平台以高性能计算软硬件系统为核心，完成数据的分析处理，获得分析结果。 其中，基因数据存储与分析平台即生物信息高性能计算系统通常包括： 计算子系统（刀片节点、胖计算节点、管理登陆节点） 存储子系统（在线存储系统、备份存储系统） 网络子系统（高速计算存储网络、低速管理网络） 管理调度系统（操作系统、集群管理系统、作业调度系统、KVM） 基础软件环境（编译器、数学库、并行环境等） 应用软件环境（生物信息平台软件、应用软件与基因组数据资源） 集群基础设施（机柜、配电系统） 机房环境（机房、制冷、监控、消防、隔音、供电等）  系统应用分析 生命科学做为21世纪最重要的科学分支之一，高性能计算在生命科学的研究和发展中起来非常重要的作用。由于测序技术的飞速发展，人类发现的基因序列数目按照指数级增长，那么对于如此数量庞大的基因进行同源性搜寻，比对，分析，遗传发育分析等等，往往伴随着巨大的数据处理量和并行计算量。同时，由于生命科学的研究对象往往是蛋白质和DNA的大分子，对这些分子的三维结构的预测，动力学特性、热力学特性、在生命过程中如何发生作用，这些科学问题也要借助于高性能计算机。所以高性能计算机在生命科学研究中，应用非常广泛，扮演着及其重要的角色。 生物信息学研究平台应用包括测序仪离线处理、序列搜寻比对分析、质谱仪原始资料处理、分子对接（药