桑树matK基因的生物信息学分析.pdfVIP

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??? 北方蚕业 ????,?????? · 试 验 研 究 ·? 桑 树 ???? 基 因的 生 物 信 息 学 分 析? 王? 晖?。? 高妍夏?。? 高德满? 高玉军?。? 张东豪?,。? 宋永学?,。? 杨贵明?,?? ??.承 德 医学 院蚕 业 研 究 所 ,河 北 承 德 ??????;?.锡 林 郭 勒 盟 第 二 中 学 ,内 蒙 古 锡 林 郭 勒 ??????;? ?.河 北 省 高 校 特 产 蚕 桑 应 用 技 术研 发 中 心 ,河 北 承 德 ???????? 摘 要? 利 用 生物 信 息 学 软 件 对 桑 树 ???? 基 因 进 行 分 析 ,对 ???? 氨 基 酸 序 列 的 理 化 性 质 、疏 水 性 /亲 水? 性 、信 号 肽 、跨 膜 结 构 域 、二 级 结 构 及 同源 建 模 、亚 细 胞 定 位 、聚 类 分析 、结 合 区进 行 预 测 分 析 ,同 时 构 建 桑树 等? ??种 生物 的 同 源树 。 结 果表 明 :???? 氨 基 酸 序 列 由 ??种 、???个 氨 基 酸 组 成 ,无 信 号 肽 ,为 亲 水 性 非 跨 膜 蛋? 白 ,二级 结 构 以 ?螺 旋 为主 ,无 法 进 行 同源 建 模 ,存 在 ?种 ?? 功 能和 ?个 结 合 区 ,亚 细胞 定位 证 实 ????氨 基? 酸 序 列 只 存 在 于真 核 生 物 叶绿 体 中,桑树 等 ??个 物 种 ???? 氨 基 酸 序 列 具有 高度 的 同 源性 。? 关 键 词 ???? 基 因? 桑树 生 物信 息 学? 桑树分类上 属于荨麻 目、桑科 、桑 属 ,在种 质 的? 二 级结 构进 行 分 析 ,?????— ?????在 线 软 件? 分类上 主要是依据 雌花的形态结 构特 征 ,按花 柱 的? 进 行 同源建 模 。通过 ??????????????对 亚 细胞 定? 长短 、柱 头突起形态进行 ??。?,由于不 同学者 提出 的? 位 、聚类 分 析 、靶 位点 进行 预测 ,应用 ??????软? 桑树分类 方法不 同 ,桑树各个种 质之 间的性状 特征? 件 对 ??个 物种 构建 同源 树 。? 差异不 明显 ,从 而 给桑 树分 类 带来 了一定 的争议 。? 表 ? 不 同 物 种 ???? 氨 基 酸 序 列来 源? 分 子生物学方法 的 出现 ,为桑树 分类 系统提 供 了一? 物种? ???????登 录 号? 个 新 的研 究 方 向。????????????????????????基 因位? 无 花 果? ??????.?? 于 赖氨酸 ????基 因的 内含 子 中 ,其 进化 速 度快 、? 啤酒 花? ??????.?? 具有 高度 多态性 ,作为一种 重要 的标记 基 因 已经在? 糙 叶树? ????????.?? 生物 物

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