基因芯片对生物学研究进展的影响幻灯片1.pptVIP

生物芯片的应用简介;对基础学科发展的影响;芯片技术用于基因序列测定;传统的基因测序方法;尿素变性的PAGE电泳胶;杂交测序原理;杂交测序原理示意图;新一代的测序原理;第一步，基因组被打断为100-200bps的片段;每个片段被接上接头序列;接头后的片段在片基上固定;;对应链的边合成边测序;该方法的优势： 1.?高通量：一轮反应可产生大于1Gb的数据； 2.?快速：产生1Gb数据的时间约为3天； 3.?成本低廉：每测量100?万个碱基对所需成本 3美元； ;两代测序方法，测序序列都是在荧光或者化学发光物质的协助下，通过读取DNA聚合酶或DNA连接酶将碱基连接到DNA链上过程中释放出的光学信号而间接确定的，除了需要昂贵的光学监测系统, 还要记录、存储并分析大量的光学图像，这都使仪器的复杂性和成本增加，依赖生物化学反应读取碱基序列更增加了试剂、耗材的使用。;新型纳米孔测序法（nanopore sequencing）是采用电泳技术，借助电泳驱动单个分子逐一通过纳米孔来实现测序的。由于纳米孔的直径非常细小，仅允许单个核酸聚合物通过，因而可以在此基础上使用多种方法来进行高通量检测。此外，纳米级别的孔径保证了检测具有良好的持续性，所以测序的准确度非常高。对于长达1,000个碱基的单链DNA分子、RNA分子或者更短的核酸分子而言，根本无需进行扩增或标记就可以使用纳米孔测序法进行检测，这使得便宜、快速地进行DNA测序成为可能。如果对现有纳米孔测序法进行进一步发展和改进，那么它将有望成为第三代测序技术（也可称为下、下一代测序技术），从而帮助人们实现24小时内只花费1,000美元完成二倍体哺乳动物基因组测序这一目标。;2008年开始的第三代测序技术则是基于纳米孔的单分子读取技术，这种方法读取数据更快、有望大大降低测序成本，改变个人医疗的前景。第三代测序技术的基本原理是在纳米孔中配置纳米电极，用电测方法测量一个DNA的核酸碱基排列。但是电测识别一个分子的技术开发极其困难，因此尚未有验证该原理的实例。 孔道蛋白：是金黄色葡萄球菌α溶血素； 纳米孔道的电位测量；;;基因表达谱芯片的应用最为广泛，技术上也最成熟。这种芯片可以检测整个基因组范围的众多基因在mRNA表达水平的变化。它能对来源于不同个体、不同组织、不同细胞周期、不同发育阶段、不同分化阶段、不同生理病理、不同刺激条件下的组织细胞内基因表达情况进行对比分析。从而对基因群在个体特异性、组织特异性、发育特异性、分化特异性、疾病特异性、刺激特异性的变化特征和规律进行描述，;进一步阐明基因的相互协同、抑制、互为因果等关系。有助于理解基因及其编码的蛋白质的生物学功能，并从已知生物学功能的基因推论未报道基因的生物学意义。同时，还可在基因水平上解释疾病的发病机理，为疾病诊断、药效跟踪、用药选择等提供有效手段。 急性白血病、黑色素瘤、卵巢癌、乳腺癌、前列腺癌、肝癌等表达谱芯片的研究。 ;基因芯片的优点： 高通量 大规模 高度平行性 快速高效 高灵敏度 高度自动化;组织芯片;;研究蛋白质芯片的意义;蛋白质检测芯片 蛋白质功能芯片 ;蛋白质芯片的制备;蛋白质芯片检测;蛋白质芯片的应用;定量检测组织提取液中的肿瘤标记物;高通量筛选蛋白-蛋白作用抑制剂;（1）疾病的蛋白质组研究 通过比较正常与病理条件下细胞或组织中蛋白质在表达量上的差异，可以发现与病理改变有关的蛋白质和疾病特异性蛋白。作为疾病诊断的生物标志物，认识发病机制，为早期诊断治疗和预防提供线索，对疾病进程进行监测与控制。 对肿瘤特异性生物标志物的检测； 在糖尿病及心血管疾病方面的应用； 对类风湿性关节炎生物标志分子的检测； 对人类细胞因子和趋化因子的测定和定量分析。 ;（2）病原微生物的蛋白质组研究 病原微生物蛋白质组研究对于阐明感染性疾病的发病机制，实现有效的预防，早期诊断和治疗，制备新的药物等方面有着重要意义。 （3）在药物开发中的应用 在病理状态下表达异常或特异性表达的蛋白质，以及细胞信号传递通路中的关键性蛋白质，都可能成为药物设计的靶分子。 （4）毒理学分析 通过发生损伤的组织器官与正常组织器官之间的蛋白质组比较，有助于阐明药物毒副作用的发生机制。; 人动脉平滑肌细胞蛋白谱;存在的问题;染色质免疫沉淀芯片（Chip-Chip） ;交联与裂解细胞;ChIP-on-chip技术能为一些重要机制的研究提供线索，包括DNA复制、修饰、修复，更重要的还有甲基化以及组蛋白修饰等等；还能帮助我们更好的 理解一些疾病的发生机理比如糖尿病、白血病、乳腺癌等。除此之外，ChIP-on-chip技术也??在一些至关重要的生命过程中为我们提供了重要的线索， 包括细胞增殖、细胞分化、癌症发生、细胞周期、细胞凋亡以及神