分 子 生 物 学 技 术;第二节 PCR;PCR技术原理;反应过程:
变性:升高温度使模板DNA变性、双链分开;
退火:再降低温度使引物与模板DNA配对互补结合;
延伸:然后升温到聚合酶反应适宜的温度,此时在聚合酶催化下,从引物3’羟基端开始,与模板DNA上的碱基配对逐个加上核苷酸,合成新的DNA链。
循环:其后再按高温变性、低温退火、适温合成三步反复循环,新合成的DNA在下一循环中又作为模板使用,每循环一次,合成的目的序列扩增一倍
;PCR反应条件的优化:
引物设计:
长度18-24bp
避免3端的互补, 否则容易造成DIMER
避免内部形成二级结构
;;退火温度:
熔解温度(Tm)是当50%的引物和互补序列表现为双链DNA分子时的温度;
合理的退火温度从55℃到70℃。退火温度一般设定比引物的 Tm低5℃;
;镁离子浓度:Mg2+离子浓度对PCR扩增效率影响很大,浓度过高可降低PCR扩增的特 异性,浓度过低则影响PCR扩增产量甚至使PCR扩增失败而不出扩增条带;循环次数:当其它参数确定之后, 循环次数主要取决于DNA 浓度。一般而言25-30轮循环已经足够。循环次数过多,会使PCR 产物中非特异性产物大量增加
;Hotstart PCR(热启动PCR)
热启动主要是通过抑制PCR反应体系一种基本成分,延迟DNA合成,直到PCR仪达到变性温度。避免了起始循环较低温
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