解晶体结构选编.ppt

晶体结构分析初步;;晶体培养;?总的原则：合适的反应与成核速率、晶体生长速率 ?环境：四季的变化，冰箱的使用 ?器皿需洗涤干净（按分析化学要求洗涤，不挂水珠） ?保持静置、防尘、少扰动 ?溶剂选择 ?“运气”？ 体系本身因素＋环境因素＋思考＋反复尝试;从溶液中结晶;液-液界面扩散法;气相扩散法(蒸气扩散法);凝胶扩散法;水热/溶剂热法;晶体的挑选;晶体的安置;衍射实验——数据收集和还原;结构解析和精修——SHELX等程序应用初步;结构解析和精修过程;XPREP子程序;Mn(OAc)2;XPREP子程序的运行;h k l Fo2 ?(Fo2);ins文件;SHELXS程序;;L.S. 最小二乘法修正轮数 要求计算键长、键角 要求计算差值傅立叶图(difmap) 规定列出Q峰的树目 ;?原子坐标：以晶胞参数a, b, c 为单位的分数坐标，x, y, z ?原子的位移参数(displacement parameters)或称温度因子(temperature factors)：表征原子的热振动 ?各向同性(isotropic)温度因子: 热振动为圆球, 用一个参数表示(B或U) U的物理意义：原子的热振动的振幅平方的平均值u2 B=8?2U ?各向异性(anisotropic)温度因子: 热振动为三轴椭球，用六个参数表示 U11, U22, U33, U12, U13, U23 ?占有率：一般位置为1，特殊位置(某种对称元素占据的位置）为0.5, 0.25, 0.125, 0.33, 等。存在统计无序时占有率亦可小于1。 ?不对称单元(asymmetric unit)或称独立(independent或unique)单元：相互之间不能通过对称操作关联的所有原子的集合;XP程序;建立模型阶段XP 常用命令的主要功能;SHELXL程序;精修的一般步骤;衍射数据的质量评价 ?分辨率：应达到 0.84A 以上，即2?在50?以上。。 ? 等效衍射点的等效性：Rint小于10%。 Rint=?|Fo2-Fo2(mean)|/?[Fo2] ? 独立区可观测点所占的百分率50％以上。低于1/2表明衍射太弱。也用Rsigma表示，应小于10%。Rsigma=?[?(Fo2)]/?[Fo2] ? 完全度大于95%。;?残差因子R( residual factor，偏离因子，吻合因子） 表征结构模型与实验数据的吻合程度;? 参数位移与偏差的比值(shift/esd 或 ?/?) shift 为修正中某参数值的漂移幅度(前后两轮修正参数的差), esd 即该变量在后一轮修正中的标准偏差 。Mean (shift/esd) 和Max (shift/esd) 用来表征结构修正的收敛性。;化学合理性检查;;生成表格与图形;