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杂交后的漂洗
1、加入探针,加灭菌水使总体积达到60mL。使用终浓度为5×105dpm/mL的标记探针;
2、加入0.1ml/cm2的杂交液到膜里。然后轻微振荡,65℃温浴过夜(如果杂交在瓶中进
行,保证杂交液体积足够使膜湿润,一般来说10-15mL/瓶)。
另一个经常使用的杂交流程,具体如下:
1、膜通过放置在含杂交液的塑料袋中进行预杂交(2-4mL/100cm2膜),DNA转移时在
65℃温浴30分钟,RNA转移时在42℃温浴30分钟;
2、煮沸5分钟变性标记的探针,之后骤冷1分钟;
3、加入足够的变性的标记探针得到每100cm2膜2ml的杂交溶液,最后探针的浓度达到
1-10pg/mL;
4、把膜从预杂交袋中取出置于新的杂交袋中,杂交溶液中含有变性的探针(在瓶中杂
交也可以使用Church 缓冲液:7%(体积:体积) SDS,250mM磷酸盐溶液pH7.4);
5、65℃(DNA) 或者42℃ (RNA) 温浴4小时或过夜。
杂交后的漂洗
把膜放入新的袋子或者容器中,然后用2mL/cm2的溶液洗膜
1、室温下用2×SSC,0.1% SDS洗15分钟;
2、室温下用1×SSC,0.1% SDS洗15分钟;
3、65℃用0.1×SSC,0.1% SDS洗20分钟 (使用前预热溶液);
4、用杂交膜轻轻地沾杂交纸以除去多余的液体,不要让膜完全干透。
该漂洗主要用于初次使用。不同的探针可能需要对漂洗时间、次数等进行优化。
注意:漂洗过度可能降低灵敏度。
如果膜需要用来再次杂交,不要让膜在任何时候干透。膜在短期内 (1个月) 可以夹
在层析纸中保存于4℃。
放射自显影
1、把湿的膜包在干净的塑料膜中;
2、在暗房中,把膜装入放射自显影片夹中,让膜与凝胶接触的那一面与X光片或者自
显影胶片(如:柯达XAR)相对,让片夹保存在-80℃中,一般曝光时间是24-48小时。
重新杂交
Biodyne系列膜可以容易地再次杂交。用于32P标记的探针的流程如下(此方法遵从F.B.I
建议,同样可以应用于非放射性的技术):在一些预杂交、杂交或封闭等包含蛋白
质体系的步骤中,可能需要用蛋白酶(0.5mg/mL蛋白酶K,0.1%SDS,65℃60分钟)预处
理,让洗脱试剂能够接触到杂交的DNA。
甲酰胺洗脱(DNA转移)
甲酰胺是一种危险的化学试剂,其健康威胁包括对接触的皮肤、眼睛或黏膜的刺激,
可造成肝损伤??摄入会导致头痛、头晕和呕吐。甲酰胺应储存于阴冷、干燥和远离火
源的区域,并且只能在通风橱里操作,并使用防化学的手套和安全的吸取设备。在操
作前请仔细阅读生产商的物质安全资料(MSDS,Material Safety Data Sheet)。
这个流程被F.B.I建议用来使用32P标记的探针杂交转移的DNA
1、在下面的溶液(20ml每cm2膜)中65℃温浴杂交膜60分钟:
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