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第04章糖蛋白和蛋白聚糖
;4.1. 概述
糖类指多羟基醛和多羟基酮及其缩合产物, carbohydrate曾译为碳水化合物;saccharide更多地与前缀组词,如monosacchride(单糖)、oligosaccharide(寡糖)和polysaccharide(多糖)等;sugar除表示食糖外还用于表述糖类的组成,常有单糖的含义;glycan则译为聚糖,是寡糖和多糖的统称。,糖类仅仅被视为主要的能源物质、碳源和结构材料,对糖类的研究局限于单糖及其代谢,以及淀粉、糖原等少数多糖。虽然早就发现糖-肽共价复合物,鉴于一些含糖的酶类去掉糖组分之后活性并无明显改变,因而把糖组分当作杂质,千方百计加以去除。;(1)复合糖的分类:
复合糖(complex carbohydrate)可分为 聚糖(glycam)和糖缀合物或糖复合物(glycoconjugate)。其中聚糖包括同聚糖(homoglycan)和杂聚糖(heteoglycan);糖缀合物则包括糖肽复合物(glycopeptede complex)、糖脂复合物(glycolipid complex)和糖-核酸复合物(carbohydrate-nucleic acid complex)。糖肽复合物可分为肽聚糖(peptideglycan)或胞壁质(murein),是细菌细胞壁结构材料;糖蛋白(glycoprotein)和蛋白聚糖(proteoglycan)。糖脂可分为糖鞘脂(glycosphingolipid)、糖基酰基甘油(glycosylacylglyceride)和脂多糖(lipopolysaccharide)。;(2)糖蛋白和蛋白聚糖中常见的单糖组分:
糖复合物中常见的单糖组分包括4种己糖:D-葡萄糖(D-Glc)、D-半乳糖(D-Gal)、D-甘露糖(D-Man)、L-岩藻糖(L-Fuc);两种乙酰化己糖胺:N-乙酰葡萄糖胺(GlcNAc)、N-乙酰半乳糖胺(GalNAc);两种糖醛酸:D-葡萄糖醛酸(GlcA)和L-艾杜糖醛酸(IdoA);一种戊糖:D-木糖(D-Xyl)以及甘露糖胺与磷酸烯醇式丙酮酸缩合产物,它的4、7、9-位羟基和5-氨基发生取代产生一系列产物,统称唾液酸(Sia),其中最重要的是N-乙酰-D-神经氨酸(NeuNAc)等。;;;(3) 聚糖结构的复杂性:
糖蛋白和蛋白聚糖的聚糖部分尽管由上述为数有限的几种单糖组成,但每种单糖有吡喃式与呋喃式结构之分,异头碳有α-与β-型之分,每个单糖有多个羟基,可能以不同的方式形成糖苷键和分枝结构。两种不同的氨基酸可形成两种二肽;3种不同的氨基酸可形成6种三肽;6种不同的氨基酸可产生176种六肽。而两种相同的己糖可能形成11种二糖;三种相同的己糖可产生176种三糖;6种不同的己糖则能形成109种六糖,如带有分枝六糖的数目可达1012个。如果考虑到糖残基不同部位进一步修饰:磷酸化、硫酸化、氨基化、乙酰化、糖基内部脱水成内醚等,聚糖的 数目无疑会更大。聚糖结构的复杂性增加了研究工作的难度,同时暗示它可以蕴含更多的信息,成为生物信息的理想载体。;(4) 糖缀合物的许多重要的性质和功能与其糖链特有的结构密切相关,为了便于表现糖链的结构,我们将采用一套流行的简化符号系统(图4.1),标明糖链单糖之间的连接方式及其修饰状况。;图4.1 推荐的描述糖链结构的简化符号与惯例
以一个复杂型分枝的双天线N-聚糖为例。除L-Fuc和L-IdoA外,其余糖基均为D-型;糖链中的单糖都是吡喃型(六元环)的;除Sia的糖苷链从C2开始,其余糖基的糖苷链均从C1开始。;4.2. 糖蛋白(glycoprotein)
广义的糖蛋白泛指糖肽共价复合物。为了研究的方便,目前已将肽聚糖和蛋白聚糖划分出来,狭义的糖蛋白专指肽链与一个或多个聚糖链共价结合形成的复合物,其聚糖链通常少于15个单糖残基(少数聚糖链可能含有200~30个单糖残基),且大多数具有分枝。;糖蛋白
;
(1)聚糖链与蛋白质的分离:
从糖蛋白释放完整的N-聚糖可采用专一的肽:N-糖苷酶F水解,也可用肼解裂解。O-聚糖可用内切α-N-乙酰氨基半乳糖苷酶水解,或在0.05~0.1mol· L-1 NaOH_ mol·L-1 NaBH4通过β-消去反应来完成。反应中产生的聚糖还原端被NaBH4还原成对碱稳定的糖醇,以防糖链被碱降解。如用3H标记的硼氢化钠,可对释放的聚糖还原端进行标记,便于在分离纯化中跟踪。也可用蛋白酶降解。产物进行分级分离与纯化,得到不同的糖肽和/或聚糖链,即可用于结构分析。;(2) 聚糖的单糖组分分析:
用糖苷酶或酸/碱将上述糖肽水解,把其中的单糖组分转变成热稳定挥发性衍生物
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