电脑与化学.doc

電 腦 與 化 學 課本 實驗 左家靜、謝定國前 言 我們利用美國西北大學 Wilensky 教授設計、研發的軟體 ---- NetLogo， Wilensky, U. (1999). NetLogo. /netlogo. Center for Connected Learning and Computer-Based Modeling. Northwestern University, Evanston, IL. ----- 以及他們使用 NetLogo 建立的模型 (Models Library)，為應用化學系同學編寫了一套「電腦與化學」的教材；內容除了介紹 NetLogo 的特性與功能，也談到與分析化學、物理化學、生物、生化反應有關的模型，希望能為同學在書本的理論、觀念和實驗課的儀器測量之間建立一座橋樑。 NetLogo 是一個功能強大的軟體，Models Library 涵蓋自然科學、社會科學各個領域，我們只引用其中和化學、生物有關的一小部份；想要更深入認識 NetLogo 的同學可以進入 NetLogo 的網站： /netlogo，或是 Wilensky 教授的首頁： /uri 。 目 錄 一、簡介1二、模型的操作 (一)8三、模型的操作 (二)16四、酸鹼滴定24五、氣體動力學 (一)32六、氣體動力學 (二)41七、指令、程序 (一)45八、指令、程序 (二)51九、反應動力學68十、Models Library 的應用76十一、複雜系統83附錄96 簡 介 NetLogo 是什麼東西？ NetLogo 是一套用 Java 語言編寫的電腦模擬程式。 NetLogo 建立的虛擬世界裡有兩組元件，如果用方格紙 (或是在一張白紙上畫好 XY 座標) 為例，第一組元件就是那些小格子，它們有自己的“位置”(XY 座標)，還可以附上其他的各種特性，但是不能移動，NetLogo 的設計師稱它們“patch”。 第二組元件是一群可以在方格紙上移動的小烏龜 (turtle)；除了受到腳下小格子的影響，小烏龜之間也能互相作用。 利用這兩組元件，NetLogo 可以幫助我們了解許多自然科學、社會科學的複雜現象，分析微觀的相互作用與巨觀整體行為的關係。 NetLogo 的作者是美國西北大學的 Uri Wilensky 教授；它是一個自由軟體，任何人都可以上網 (/netlogo) 下載，安裝在自己的電腦上。 美國西北大學的 Center for Connected Learning and Computer-Based Modeling (CCL) 用 NetLogo 建立了許多複雜系統的模型，涵蓋生物、化學、物理、材料、地球科學、數學、電腦 (computer science)、網路 (networks)、系統動力學 (system dynamics)、社會科學等等。 學生可以在虛擬世界裡直接觀察各種複雜現象，不僅能得到由下而上 --- 從組成分子的相互作用決定系統整體的行為模式 --- 的概念，更能調整模型中設定的參數，學習操控複雜系統的功能。 他們發現利用電腦模擬讓學生“看到”、“接觸到”複雜系統的變化，是學習各種與複雜現象相關的觀念、理論最有效的方法。 從細胞的新陳代謝到中東的動盪情勢，我們周遭發生的事情都是複雜系統的表現。 近年來複雜系統的研究已有相當成果，許多想法、理論不僅得到證實，還應用在科學、工程、醫學、財金、法律、管理各個領域。 二十一世紀教育的主題之一就是教導學生了解複雜系統，以複雜系統的模型從事科學研究，進而應用在藥物、醫療方法的設計，光電、生化各項科技的研發，企業、組織、政府的決策，以及能源、環保、地球生態的經營。 NetLogo 一方面夠簡單，老師、學生都能很容易的學會操作，甚至建立自己的模型；另一方面，這個程式的功能強大，具有同時處理數千個“代理單元”(agent，也有人譯為代理人或是智能體；先前提到的每一個“patch”，每一隻“turtle”都是一個“agent”) 的能力，可以應用在許多進階的研究領域上。 NetLogo 的下載與安裝 在 Internet Explorer 的網址列輸入 /netlogo/，可以進入 NetLogo 的首頁： 點選左邊的“Download”，顯示的畫面可以連接到“System Requirements”，告訴我們電腦必須具備那些條件才能安裝 NetLogo；也能連接到“Models Library”，在那兒可以找到所有用 NetLogo 建立的模型，包括美國西北大學納入教學課程的“curricular models”，以及正在改進、檢測中的模型 (標