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SNP与疾病关联分析
SNP与疾病关联分析;背景了解;1.SNP概述;| ;2.研究SNP的意义;3. SNP常用分析方法;4. PCR测序法 介绍;测序及峰图分析：chromas软件;从小样本信息中获得SNP信息，筛选SNP点扩大样本进行实验
基于case/control的统计学分析，包括卡方、风险R等，建议SPSS软件
Haplotype分析，相关软件accelerated EM algorithm ; 注意事项
为保证待测目的区域测序真实可靠，引物设计应该使待测目的区域边界距离上下游引物至少各50bp
引物设计建议使用在线方式，原则从简；为保证引物的特异性，建议引物设计后在NCBI上blast确认
为保证测序敏感性，PCR产物片段大小应在250bp－650bp范围；扩增条件以简单为原则
为方便实验，建议引物合成时分装成1 o.d/管，方便将PCR反应引物与测序引物分开；
为防止降解，PCR产物应尽快测序，否则应该保存在-20℃，且时间不宜过长；
序列读取看峰图（chromas软件，免费），不要看序列文档！为保证结果真实性，建议对关键点进行反向测序确认。 ;5.生物信息学与SNP;应用举例;Polymorphism;;Gene;Gene;Gene;Gene;Gene;Name;Block
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