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SDSPAGE凝胶电泳2是
SDS凝胶电泳;SDS凝胶电泳;实验步骤;(4)1.0mol/LTris-HCl缓冲液(pH6.8):
称取Tris12.1g,加入50ml水,用1mol/L盐酸调pH6.8,最后用蒸馏水定容至100ml
(5)0.05mol/LTris-HCl缓冲液(pH8.0):称取Tris0.6g,加入50ml水,用1mol/L盐酸调pH8.0,最后用蒸馏水定容至100ml
(6)TEMED(四甲基乙二胺);(7)样品溶解液:
SDS(100mg)+巯基乙醇(0.1ml)+ 溴酚蓝(2mg)+甘油(2g)+ 0.05mol/L pH8.0Tris-HCl(2ml),最后定容至10ml
(8)固定液:50%甲醇454ml,冰乙酸46ml混匀
(9)染色液:称取考马斯亮蓝R250 0.125g,加上述固定液250ml,过滤后备用;(10)脱色液:
冰乙酸75ml,甲醇50ml,加蒸馏水定容至1000ml
(11)电极缓冲液
(内含0.1%SDS,0.05mol/LTris- 0.384mol/L甘氨酸缓冲液pH8.3):称Tris6.0g,甘氨酸28.8g,加入SDS1g,加蒸馏水使其溶解后定容至1000ml;2. 聚胶前准备;3.不连续系统下层分离胶的聚合;4.???连续系统中的上层浓缩胶 和连续系统凝胶的聚合; 同前将激活剂混合均匀,但摇动溶液时不要摇得过于剧烈以免引入过多的氧气。 吸去不连续系统中下层分离胶上的水分,以连续平稳的液流注入凝胶溶液,然后小心插入梳子并注意不得在齿尖留有气泡。 静置90 min以上以保证完全聚合。 如果在聚胶过程中发现一道道纹线,即凝胶不均匀,可能是聚合速度太快或激活剂未充分混合导致局部浓度过高。; 凝胶聚合的速度可以通过紫外吸收检测,由于丙烯酰胺中的双键在260nm有吸收,聚合后双键消失,光吸收减低。将凝胶溶液倒入石英比色杯中,可观察到20~30 min后光吸收读数开始下降,至80 min以后趋于稳定,说明聚合完成。;5.电泳; 垂直板电泳装置;水平式电泳装置;电泳过程中分子迁移的规律,小分子走在前头,大分子滞后。电泳凝胶相当于凝胶过滤中的一个带孔胶粒。;6.染色和脱色;电泳后的凝胶经考马斯亮蓝染色、脱色后的凝胶照片;7.结果处理 ;夹在两块玻璃板之间的凝胶;标准蛋白分子量;实验注意事项;3. TEMED中混有氧化试剂后其自身极易被氧化而失去催化能力,另外TEMED的氧化产物呈黄色,以此可以鉴定TEMED的质量。如果无法获得无色透明的TEMED,只能适当增加用量以保证聚胶速度。;4. 过硫酸铵容易吸潮,由于它溶解于水后很快降解失去催化能力,因此潮解后的过硫酸铵会渐渐失去活性。保存固体过硫酸铵应密闭干燥。过硫酸铵溶液宜制胶当天配制。另外在配制凝胶溶液时过硫酸铵不易过量,否则会使蛋白质在电泳过程中被氧化(主要指天然无变性剂凝胶)。;5. 激活剂的用量: 激活剂的浓度适当与否不仅可以决定凝胶聚合的速度,也将影响凝胶的质量。增加过硫酸铵或TEMED的用量,将使丙烯酰胺聚合链长度缩短,凝胶会变得脆弱而失去应有的柔性。二者多至一定程度时,聚合链长度过短,将不会形成肉眼可见的凝胶,这些短链多聚物呈溶液状,只是其粘度较聚合前高一些。; 6. 温度的影响聚胶的最佳温度为23~25 ℃ ,需要注意灌胶前单体溶液(通常置于4℃冰箱)及玻璃板或管(有时从烘箱取出)也要平衡至此温度。由于溶液在抽真空时仍维持较低温度,需待其升至室温后再脱气,另外升温后脱去氧气的速度较低温时快。; 7. 氧气的影响氧气会与被激活的单体自由基作用抑制聚合过程,因此需在加激活剂前对单体溶液脱气。如果省去这一步骤,凝胶仍能聚合但需更多的激活剂,并且不能保证很好的重复性,充分去除氧气可以用尽量少的激活剂得到最佳聚合效果。通常在较好的真空度(<125torr)脱气至少15 min 。; 8. 凝胶添加剂:凝胶中常常加入SDS、尿素、Triton X-100等添加剂。SDS加入后不会对凝胶的聚合产生影响,但尿素会使凝胶孔径变小,这一特性可用来分离小分子蛋白质或多肽。; 9. 聚胶时间:虽然应用过硫酸铵/TEMED催化后灌胶15~20 min即可观察到凝胶的形成,但至少需90 min才能保证95%以上的单链聚合成长短以及具有合适的孔径大小。采用核黄素时聚胶时间需更长,但它一般用于等电聚焦即根据蛋白质的电荷性质进行分离,对孔径大小要求不高,因此不必等很长时间(完全聚合需8 h)。; 10. 单体的浓度:是指单体总重量(丙烯酰胺+bis)在溶液中的百分比(w/v),可选择的范围为3%~30%,单体浓度增加后聚合速度将加快
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