乳腺癌组织学分级下目标基因提取及转录调控网络构建 (1).pdfVIP

安徽 医科 大学 学报 ?????????????????????????????????????????????；??????? · ????·? 乳腺癌组 织学分级下 目标基 因提取及转 录调控 网络构建? 孔 薇?，李海燕?，牟晓阳?，杨 呖? 摘要? 目的 乳腺癌 类型 和分 级多样 性导致 其预后 差别 显? ? 材料 与方 法? 著 ，探寻乳腺癌 不同分级情况下 的基 因表达 差异及调控关 系? 能够 为乳腺癌致病机 制 的发现 提供重要 依据 。方 法 对 不? ?．?数据来源 选用的乳腺癌基 因表达数据来 自美? 同分 级下 的乳 腺 癌基 因表 达数 据 利 用 快速 独 立 成 分 分析? 国国立生物技 术信 息 中心 ?????????????????????????? ?????????方法提取 特征 基 因，并 结合 人类 蛋 白质相 互作用? ??????????????????????，?????基 因表达数据库 中的? ?????数据选取 目标 基 因。在 此基础 上 ，结合 转 录因子对靶? 数据集 ????????。该数据集 收集 ???例乳腺癌患? 基 因调控的先验信息 ，利用网络成分分析 ?????方 法对 与乳? 者样本 ，年龄 ??～??岁 ，平均年龄 ??岁 ，包括 ??个? 腺癌 发病 有密切关系 的转 录因子及 其靶基 因构 建转 录调控? 乳腺癌 ?级 ???，高分化 ?样 本、??个乳 腺癌 Ⅱ级? 网络 。结果 筛选出 的基 因经 过数据 库验 证与 乳腺 癌相关? ???，中分 化 ?样本 和 ??个乳 腺癌 Ⅲ级 ???，高分? 的占 ??．??％ ，构建 的调控 网络发 现了多个 转 录 因子 及靶基? 化 ?样本 ，另取了 ??个正常的乳腺组织作为对照样? 因在不 同分级 情况下的活性变化趋势 。结论 ???????算法? 本 。人类蛋 白质 一蛋白质 相互作用 ????????—???????? 结合 ???数 据提取 目标基 因的方法 较 为有 效 ，通过 ???算? ???????????，????数据来 自 ??????? ???????????????—? 法构建 的转 录调控网络 为研究 乳腺癌 发生 发展机 制提供 了? ????????????????????????????????????????，????：／／??????—? 新 的方法 。?