谷子淀粉结合域蛋白基因家族序列特征及干旱胁迫响应表达分析_王晶蓉.docVIP

谷子淀粉结合域蛋白基因家族序列特征及干旱胁迫响应表达分析_王晶蓉 （ＪＮＳＥ．ＳＨＡＮＸＩＡＧＲＩＣ，ＵＮＩＶ．ａｔｕｒａｌｃｉｅｎｃｅｄｉｔｉｏｎ ） （）：自然科学版）学报（０１６，３６１２８５５２３４８６０ 谷子淀粉结合域蛋白基因家族序列特征及干旱胁迫响应表达分析 ２，３＊３，付荣１，张泽１，李红英１，侯思宇１，王晶蓉１， （山西农业大学农学院，农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点山西太谷０１．３０８０１；２． ）实验室，山西农业大学生物工程研究所，山西太原０山西太谷０３００３１；３．３０８０１ ［谷子属于耐旱杂粮作物，但谷子响应干旱胁迫的相关基因分子机制仍不清楚。为了明确谷子干旱胁迫摘　要：目的］ 方法］是否与淀粉代谢关键酶基因相关，探索谷子抗旱的分子机制。［运用生物信息学初步分析了谷子该家族基因的 基本序列特征、启动子元件预测。构建该基因家族直系同源系统进化树，分析与其他物种同源蛋白的亲缘关系。基于数字基因表达谱数据分析了Ｐ该基因家族在谷子抗旱品种‘勾勾母鸡咀’和敏感性品种‘晋汾ＥＧ模拟干旱条件下， ’的表达特征。［结果］谷子全基因组调查表明该基因家族有五个成员，暂且命名为Ｓ６ｉＳＢＤ１、ｉＳＢＤ２、ｉＳＢＤ３、ＳＳ１ 蛋白分ＳｉＳＢＤ４和ＳｉＳＢＤ５。序列分析表明，该基因家族成员编码的蛋白序列长度范围为３６０～９４９个氨基酸残基； 蛋白质等电点为４主要包子量范围为３９～１０８ｋＤ，．１８～６．７２。启动子元件分析鉴定出与抗旱相关的顺式作用元件， 含：与ＭＹ与Ｍ与植物防御和非Ｂ抗旱基因调控相关，ｅＪＡ、ＥＴＨ、ＳＡ、ＡＢＡ等在抗旱中起重要作用的植物激素相关， 谷子Ｓ生物胁迫响应相关。系统进化树表明，谷子ＳｉＳＢＤ１基因与高粱和玉米同源蛋白ＳＢＤ聚为一类，ｉＳＢＤ２基因 其他３个基因归为一类。进一步分析Ｐ与玉米ＳＳＢＤ２、ＢＤ３基因的聚为一类，ＥＧ胁迫下谷子淀粉结合域蛋白基因家 ’中表达降低，结果表明：勾勾母鸡咀’中表达增加，在敏感性品种‘晋汾１而其他４个基族表达，ｉＳＢＤ１在抗旱品种‘６Ｓ 因的表达在这两个品种中均降低。［结论］该研究结果暗示了淀粉代谢关键酶Ｓ可为谷ＤＢ基因家族与干旱胁迫相关，子抗旱育种提供一定的理论基础。 ；抗旱性；关键词：谷子；分子机制ＳＴＢＤ；ＣＧＴａｓｅＧＡＡ； （）中图分类号：５１５　　文献标识码：Ａ　　文章编号：１６７１１５１２０１６１２８５５５８００Ｓ－－－ DOI:10.13842/j.cnki.issn1671-8151.2016.12.017 ＳＳｅｉｎｒｅｓｏｎｓｅｔｏｄｒｏｕｈｔｓｔｒｅｓｓｉｎｅｕｅｎｃｅｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓａｎｄｅｘｒｅｓｓｉｏｎａｎａｌｓｉｓｏｆｉＳＢＤｇｎｅｆａｍｉｌ ｐｇｑｐｙｙ　 Ｓｉｅｔａｒｉａｔａｌｉｃａ　 １１１１２３＊１３，，ＷＦＺＬＨａｎＪｉｎｒｏｎｕＲｏｎｈａｎＺｅｉＨｏｎｉｎｏｕＳｉｕ ｇｇｇ，ｇ，ｇｇｙｇｙ　　，，， （１ｏＡｒＡｒＵ０ＣＬｏＣ．Ｃｏｌｌｅｅｉｃｕｌｔｕｒｅ，Ｓｈａｎｘｉｉｃｕｌｔｕｒａｌｎｉｖｅｒｓｉｔａｉｕ３０８０１，ｈｉｎａ；２．Ｋｅａｂａｒａｔｏｒｒｏ 　ｆ　ｇｇｆ　ｇｙ，Ｔｇｙ　ｙｐ　 ＲａＧＥｏＬＰｏＡｒ０ＣＧｅｎｅｅｓｏｕｒｃｅｓｎｄ　ｅｒｍｌａｍ　ｎｈａｎｃｅｍｅｎｔｎ　ｏｅｓｓｌａｔｅａｕ，Ｍｉｎｉｓｔｒｉｃｕｌｔｕｒｅ，Ｔａｉｕａｎ３００３１，ｈｉｎａ； 　　ｆ　ｇｐｙｙ　 ３ｏＡｒＢＳＡｒＵＴ０Ｃ．Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｉｃｕｌｔｕｒａｌｉｏｅｎｉｎｅｅｒｉｎｈａｎｘｉｉｃｕｌｔｕｒａｌｎｉｖｅｒｓｉｔａｉｕ３０８０１，ｈｉｎａ） 　　ｆ　ｇｇｇｇ，ｙ，ｇ ：，ｂＡｔｔｂｓｔｒａｃｔＦｏｘｔａｉｌｍｉｌｌｅｔｉｓｄｒｏｕｈｔｏｌｅｒａｎｔｃｒｏｕｔｔｈｅｍｏｌｅｃｕｌａｒｍｅｃｈａｎｉｓｍｓｒｅｌａｔｅｄｔｏｄｒｏｕｈｔｏｌｅｒａｎｔａｒｅｓｔｉｌｌｕｎ－－－ 　ｇｇｐ ［］ｌｅａｒ．ＯｂｅｃｔｉｖｅＴｈｉｓｓｔｕｄａｉｍｅｄｔｏｄｅｔｅｒｍｉｎｅｗｈｅｔｈｅｒｔｈｅｄｒｏｕｈｔｏｌｅｒａｎｔｃｈａｒａｃｔｅｒｏｆｆｏｘｔａｉｌｍｉｌｌｅｔｗａｓｒｅｌａｔｅｄｔｏｔｈｅｃｔ 　　－ｊｙｇ　 ｋｅｅｎｚｍｅｓｏｆｓｔａｒｃｈｍｅｔａｂｏｌｉｓｍａｎｄｌａｔｈｅｆｏｕｎｄａｔｉｏｎｆｏｒｔｈｅｆｕｒｔｈｅｒｓｔｕｄｏｎｔｈｅｍｏｌｅｃｕｌａｒｍｅｃｈａｎｉｓｍｏｆｄｒｏｕｈｔｒｅ－ 　ｙｙｙｙ