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0409第十一章蛋白质的生物合成1_1

第十一章 蛋白质的生物合成 ;第一节 遗传密码; 密码子或称三联体密码,即mRNA上决定一个特定氨基酸的三个核苷酸 。 3. 密码子的确定 用各种人工合成模板在体外翻译蛋白质的方法确定 用核糖体结合技术测定密码子中的核苷酸排列顺序 1961年 ~1965年4年时间,完全确定了编码20种天然氨基酸的密码子,编出了遗传密码字典。 ;二、遗传密码的基本特征 1. 遗传密码的连续性(commaless) 密码子之间没有任何起“标点”作用的空格,阅读mRNA时是连续的,一次阅读3个核苷酸(碱基).; 2. 遗传密码的不重叠性(nonoverlapping) 在绝大多数生物中,阅读mRNA时是以密码子为单位,不重叠地阅读。 少数大肠杆菌噬菌体的RNA基因组中部分基因的遗传密码是重叠的。;3.遗传密码具有简并性(degeneracy) (1)除Met(AUG)和Trp(UGG)外,每个氨基酸都有两个或更多的密码子,这种现象称为密码子的简并性(degenecy)。 (2)同义密码:同一个氨基酸的不同密码子称同义密码子(synonyms)。 (3)简并性的生物学意义 减少有害突变,对生物物种的稳定有一定意义。 (4)密码的简并性往往表现在密码子的第三位碱基上; ;4. 密码的变偶性——摆动性(wobble) tRNA上的反密码子与mRNA上的密码子配对时,密码子的第一位、第二位碱基配对是严格的,第三位碱基可以有一定变动, Crick称这种现象称为密码的摆动性或变偶性(wobble)。如tRNA反密码子第一位的I?A、U、C配对。 显然, 密码子的专一性基本取决于前两位碱基,第三位碱基起的作用有限(有较大灵活性)。所以几乎所有氨基酸的密码子都可以用 和 来表示. ; ;5.遗传密码的通用性和变异性 (1)通用性:指各种低等和高等生物,包括病毒、 细菌及真核生物,基本上共用一套遗传密码. (2)密码的变异性:目前已知线粒DNA(mtDNA)的编码方式与通用遗传密码子有所不同.; 6.密码子有起始密码子和终止密码子 (1)起始密码子:AUG(Met)多数原核,真核生物 GUG 少数情况 (2)终止密码子:UAA、UAG和UGA 不编码任何氨基酸, 又称为无义密码子(nonsense codons)或终止密码子(chain-terminating codons), 它们单个或串联在一起用于多肽链翻译的结束,没有相应的tRNA存在。 ;第二节 核糖体;二、核糖体的结构;三 核糖体的活性位点 ;四、核糖体的功能;第三节 转移RNA的功能;;3’;第四节 蛋白质生物合成的分子机制;二、mRNA 上翻译的方向 1. 用人工合成的多核苷酸作模板证明 ;三、原核生物蛋白质生物合成的分子机制; 20种氨基酸中每一种都有各自特异的氨酰-tRNA合成酶。 氨酰-tRNA合成酶具有高度的专一性,它既能识别相应的氨基酸(L-构型),又能识别与此氨基酸相对应的一个或多个tRNA 分子;即使AA识别出现错误,此酶具有水解功能,可以将其水解掉。这种高度的专一性保证了氨基酸与其特定的tRNA准确匹配,从而使蛋白质的合成具有一定的保真性。;(二)肽链合成的起始 1.70S起始复合物的形成 (1)起始氨基酸及起始tRNA ;原核:甲酰甲硫氨酸 ( fMet );细菌中的起始因子: IF1: 结合在30S亚基上作为完全起始复合物的一部分,起稳定此复合物的作用。 IF2: 结合到特异的起始tRNA(fMet-tRNA),并将起始tRNA置于小亚基上。 IF3:30S小亚基特异地与mRNA起始部位结合需要 IF3 .IF3还作为70S核糖体的解离因素,产生30S亚基。;;(三)肽链的延长 ; 2. 转肽: 1) 肽酰基从P位转到A位,肽键的形成; 2) 负责肽键合成的酶称为肽酰转移酶(peptityl transferase),简称转肽酶。 3) 肽的转移是核糖体大亚基(50S或60S)的功能。 4)抗菌素嘌呤霉素抑制蛋白质合成,使新生的肽链在合成未完成之前就释放出来。 ;;3. 脱落; 4. 移位: 1) 核糖体向mRNA 3′端移动一个密码子,移位导致肽酰-tRNA从A位点移

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