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新一代遗传标记-拷贝数多态
——
Copy Number Variations
TaqMan® Copy Number Assays
异
• -
• RFLP
• STRAlu
• SNP
• New Copy Number Variations
2
CNV
Copy Number Variation (CNV)
– DNA
– 1 kbCNVs 10 Kb;
CNVs 1 Mb
–
1kb DNA
2 ; 90% .
•
CNVs :
– HIV/AIDS susceptibility (CCL3L1)
– Rheumatoid Arthritis
– Neuropathies (PMP22)
– Type I diabetes
– Lupus -(FCGR3B C4)
– Crohn’s disease(DEFB4)
– Cancer
– Drug Metabolism (e.g. CYP2D6)
Redon, et. al. (2006 )Nature 444, 444-454.
3
CNV
CNV
•
•
• beta DNA
CNV
•
• miRNA
CNV6MB
• CNV
4
Copy Number Variation
——CCL3L1
•CCL3L1——5(CCR5)HIV-1
•CCL3L1(~3)(~6)
•CCL3L1HIV-1ccl3l1+CCR
HIV-1
5
Genomic Variants–CNVs
http://projects.tcag.ca/variation/
DGV/Toronto/Sick Kids database
Includes CNV discovery data from
Array Comparative Genomic
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