蛋白质功能预测方返抹概述_刘言.pdfVIP

11 1 Vol． 11 No． 1 第 卷 第 期 生物信息学 2 0 1 3 3 Chinese Journal of Bioinformatics Mar． ，20 13 年 月 doi :10. 3969 /j ． issn． 1672 － 5565 ． 20 13． 0 1． 06 蛋白质功能预测方法概述 1 1 1* 2 ★ ， ， ， 刘 言 沈素萍 方慧生 陈凯先 (1． ， 210009 ;2 ． ， 20 1203) 中国药科大学生命科学与技术学院 江苏南京 上海药物研究所药物发现与设计中心 上海 : ， 摘 要 蛋白质是生物体内最必需也是最通用的大分子 对它们功能的认识对于科学领域和农业领域的发展有着至关重要的 。 ，NCBI ， 作用 随着后基因组时代的发展 数据库中迅速涌现出大量不明结构与功能的蛋白质序列 这些蛋白质序列甚至一跃成 。 。 3D 了研究的热点 近几十年来蛋白质功能预测的方法不断被完善 由最初的仅基于蛋白质序列或 结构信息的方法衍生出 、 、 ， 、 更多的基于序列相似性 基于结构基序 基于相互作用网络等新方法 这些新型方法采用新的算法 新的研究思路和技术手 ， ， 。 ， 段 力求得到准确性与普遍性并存 能够被广泛应用的蛋白质功能预测方法 本文综述了近年来蛋白质功能预测的方法 并 ， 。 将这些研究方法分类归纳 各自阐明了每类方法的优缺点 : ， ， ，ESG 关键词 蛋白质功能预测方法 结构基序 相互作用网络 中图分类号:Q51 文献标识码:B 文章编号:1672 － 5565 (2013)－ 01 － 033 － 06 An Overview of protein function prediction methods LIU Yan1 ，SHEN Su － ping1 ，FANG Hui － sheng1* ，CHEN Kai － xian2 ★ (1． Lif e Science and Technology of China Pharmaceutical University ，Nanj ing 210009 ，China ; 2． Drug Discovery and Design Center in Shanghai Drug Ｒesearch Institute ，Shanghai 20 1203 ，China) Abstract :Protein is the most necessary and versatile macromolecules in vi