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如何用ImageJ进行WB定量
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如何用ImageJ 进行WB 定量?
WB 是研究蛋白表达的一个经典方法。对于一些时间点或者是不同组织蛋白
表达量的分析,就涉及到量的变化。一些凝胶成像软件带有此分析工具,比如
Bio-Rad,Kodak,Li-cor 等公司的成像系统。除了这些软件,还有一个比较
简单的图像处理软件ImageJ 可以很方便的进行灰度分析。ImageJ 主页是
/ij/index.html,更多资料可以访问。这里只是简单
介绍一种灰度分析的方法。
很容易就能从主页下 并安装 ImageJ,从下面简单的几步操作就能完成
WB 定量分析。
1. 打开文件;
2. 把图片转化成灰度图片:ImageType 选8-bit;
3. 消除背景影响:ProcessSubtract Background. 选择50 基本可以。
4. 设置定量参数: AnalyzeSet Measurements, 点击面积,平均密度,和
灰度值及Integrated Density;
5. 设置单位 AnalyzeSet Scale,在“Unit of length” 边的方框里输入
pixels;
6. 把图片转换成亮带,EditInvert ;
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7. 选择Freehand Selection ;尽量把条带圈起来;点击键盘m,出来IntDen
灰度值;
10. 用“Freehand Selection”选择下一条带,按m 进行测量。
11. 当测定完所有条带,选结果中的 “Edit ”的 “Select All”,然后复制数据
“IntDen”到Excel 表即可进行分析。
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