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用和进行群落系统进化分析张金龙中国科学院植物研究所软件是哈佛大学的博士俄勒冈大学的博士加州大学伯克利分校的教授编写的一套用于群落物种组成系统发育关系的软件是在线软件可以利用植物名录按照的被子植物科的拓扑结构生成进化树由于当前物种测序还不够充分某一个群落中或某一个地区所有物种的某几个基因的序列还不能全部拿到因此可以用建立基于骨架的进化树软件是用来进行群落系统发育与进化分析的可以为软件得到的进化树拓扑结构按照一定的规则拟合一定的枝长其功能还包括计算群落的系统发育多样性计算群落的系统发育结构计算群落的
用Phylomatic和PhyloCom进行
群落系统进化分析
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张金龙?Jinlongzhang01@
?（中国科学院植物研究所）
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PhylomaticPhyloCom软件，是哈佛大学的Cam Webb博士、俄勒冈大学的Steve Kembel博士、加州大学伯克利分校的David Ackerly教授编写的一套用于群落物种组成系统发育关系的软件。
Phylomatic是在线软件，可以利用植物名录，按照APGIII的被子植物科的拓扑结构，生成进化树。由于当前物种测序还不够充分，某一个群落中或某一个地区所有物种的某几个基因的序列还不能全部拿到，因此可以用Phylomatic建立基于APGII
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