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- 2017-05-09 发布于湖北
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第9章 催化策略(刘建华)精要
Biochemistry
Sixth Edition;国际象棋和酶都使用策略,国际象棋通过比赛发展策略,而酶则通过进化建立酶促反应机制。右边是能够酶切肽键的活性位点,由三个氨基酸残基(化学键是白色)构成。用黑色化学键表示的底物分子如同左边比赛中已经落入圈套的国王,面临被裂解的命运。;酶催化效率高、特异性强、条件温和。
这些特征的基础是什么?
介绍四类酶促反应的机制:丝氨酸蛋白酶、碳酸脱水酶、限制性核酸内切酶、和核苷单磷酸激酶。前三类将水分子加成到底物分子上,第四类避免水分子的加成。
经过大量的实验研究(包括蛋白质结构测定、定点突变),发现:酶的催化机制基本策略是结合能、诱导匹配、和一些特殊的催化策略,协助底物形成转化态;每类酶的催化机制能解决各种化学反应所面临的问题。
蛋白酶:将缺乏催化剂和pH 7.0几乎不发生的反应 (蛋白质水解)???行下去。
碳酸脱水酶:将化学反应加速到能够与其他快速生理过程融合的水平。
限制性内切酶:实现酶切反应的高度特异性。
NMP激酶:把磷酸基团从ATP转移给另一个核苷酸(而不会转移到水分子)。; 酶采用的几个基本的催化原则
底物与酶结合启动催化。结合能是酶和底物之间形成大量弱相互作用所释放的自由能。这种结合能 既可建立底物特异性,又能增加酶促效率。当底物转化成转化态,底物与酶之间完全互补。因此底物和酶之间的相互作用稳定转化态,从而降低
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