第三章 数据库查询与搜索2精要.ppt

第三章 数据库查询与数据库搜索 目 录 §3.1 引言 §3.2 数据库查询 §3.3 数据库搜索 §3.4 向数据库提交序列 三、Entrez查询系统 Entrez查询系统: 是美国国家生物信息中心（NCBI)开发管理的、国际上最为著名的生物信息数据库查询系统。该系统通过“交叉引用”（cross-references)的方法将各类信息包括DNA序列、蛋白质序列、蛋白质结构信息（如结构域和三维结构）、基因组和基因图谱及著名的PubMed文献信息等有机地整合在一起。 硬连接： 查询要点之二：关键词的书写规则 查询要点之三：辅助选项的巧妙使用 Limits 查询要点之四：利用子库之间的交叉引用进行信息查询 查询要点之五：全库查询 四、SRS查询系统 §3.3 数据库搜索 三、BLAST搜索 四、FastA搜索 五、Vast搜索 §3.4 向数据库提交序列 The end! 在分子生物学研究中，对于新测定的核酸序列或氨基酸序列，如何获得其基本信息，研究其相关功能？ 要解决这些问题最简单的方法就是和其它已知序列进行比较，根据其相似性推断其功能。这种方法在生物信息学中称为序列比对（Sequence Alignment） 寻找相似序列有哪些方法呢？ Blast、FastA等搜索工具 Any G or A or T or C N not-C G or A or