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DNA甲基化作用的生物学功能 陈舒文 生科院07级1班 摘　要: DNA甲基化作为DNA序列的修饰方式,是一种重要的表观遗传机制,能够在不改变DNA分子一级结构的情况下调节基因组的功能,在生命活动中起着重要的作用。其功能主要可归结为以下4个方面:维持基因组遗传物质的稳定性,调控基因的表达,建立表观遗传模式以及参与细胞及胚胎的形态建成。 关键词: DNA甲基化;DNA甲基转移酶;表观遗传;印迹基因; X - 染色体失活 DNA 甲基化作用(DNA methylation ) 是在DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase, Dnmt)的催化下,以S - 腺苷甲硫氨酸( S2adenosyl2methi2onine, SAM)为甲基供体,将甲基( - CH3 )转移到DNA分子中特定碱基上的过程,最常见的是在胞嘧啶上形成5′甲基胞嘧啶[ 1 ] 。DNA甲基化作为DNA序列的修饰方式,是一种重要的表观遗传机制,能够在不改变DNA分子一级结构的情况下调节基因组的功能,在生命活动中起着重要的作用。诸如:保持基因组遗传物质的稳定性;调控基因的表达;建立表观遗传模式以及参与细胞及胚胎的形态建成等。在植中,DNA甲基化主要参与植物基因表达的调控,进而调节植物的生长发育。DNA甲基化在植物开花、植物花器官形成的调控以及植株转基因过程中的基因沉默中都发挥作用。植物体可以通过甲基化、去甲基化和从头甲基化来控制基因的表达,使基因可在自身需要时表达,不需要时关闭表达,这样植物就能在不同的环境条件、不同的发育阶段调控基因的时空表达。 DNA 甲基化模式与DNA 甲基化相关的酶 1.1　DNA甲基化模式 DNA甲基化的主要形式有5 - 甲基胞嘧啶、N6 - 甲基腺嘌呤和N4 - 甲基腺嘌呤[ 1 ] 原核生物可对胞嘧啶与腺嘌呤甲基化,而真核生物中甲基化仅发生于胞嘧啶。在哺乳动物基因组中,DNA甲基化的主要位点是CpG二核苷酸位点,它在基因组中呈不均匀分布。启动子区的CpG岛通常处于非甲基化状态,基因能正常表达;当其发生甲基化时,会影响基因的转录调控,使基因表达 发生沉默。当肿瘤发生时,抑癌基因CpG岛以外的CpG位点的非甲基化程度增加,而CpG岛中的CpG位点则呈高度甲基化状态,造成染色体的结构改变从而使抑癌基因沉[ 2 ] 。在高等植物中还存在另外两种DNA甲基化位点,即CpNpG位点与CpNpM非对称位点,主要通过植物所特有的一类甲基化转移酶CMT进行维持[ 3 ] 。 1.2　DNA甲基化转移酶 目前,在大肠杆菌中发现了两种与甲基化形成相关的酶,即使腺嘌呤甲基化的脱氧腺苷甲基化酶(Dam)和使胞嘧啶甲基化的脱氧胞苷甲基化酶(Dcm) ,两者都是以S - 腺苷甲硫氨酸为甲基供体,主要与寄主所控制的限制与修饰相关。在不同真核生物中甲基转移酶的分布各不相同[ 3 ] 。有的生物如秀丽线虫(Caenorchabditis ele2gans)与酿酒酵母( Saccharom yces cerevisiae)的基因组中检测不到甲基化的存在,甚至没有甲基化转移酶的编码序列;但是有的生物如拟南芥中就存在至少十种甲基转移酶的基因。根据甲基转移酶C - 端催化结构域的保守性,可以把DNA甲基转移酶分为4个不同的家族[ 3 ] : DNA甲基转移酶1 (DNA methyltransferase21, Dnmt1 ) 家族, Dnmt3家族, Dnmt2 家族及CMT ( chromomethylase )家族[ 2 ] 。Dnmt1是真核生物中发现的第一个甲基转移酶,为组成型DNA甲基转移酶。它与DNA的复制直接相关,可以对半甲基化的新生子链进行甲基化,从而在细胞分裂中维持甲基化模式在亲子代中的传递。Dnmt1也具有一定的从头甲基化的能力,其变体Dnmt1o能够参与甲基化模式的建立与印迹基因的等位特异表达等。此外, Dnmt1也具有依赖于DNA 复制的去甲基化的功能[ 4 ] 。Dnmt1家族在植物中特称为MET家族。Dnmt3家族包括Dnmt3a与Dnmt3b,为组织特异性的DNA甲基转移酶,在胚胎干细胞和早期胚胎中高度表达,参与DNA甲基化的从头合成所建立新的甲基化模式。Dnmt3a与Dnmt3b所介导的甲基化目标位点是不同的,后者能够特异地对着丝粒卫星重复序列进行从头甲基化。此外,Dnmt3也可能是胚胎发育中主动去甲基化的执行者[ 4 ] 。Dnmt3L缺乏甲基转移酶活性,可能主要是协助Dnmt3a与Dnmt3b完成卵母细胞甲基化的建立。Dnmt3家族在植物中特称为DRM家族。Dnmt2 家族也具有胞嘧啶甲基转移酶的活性。Goll等[ 5