SNP及人类疾病.pptVIP

依据连锁不平衡（LD），基因内block情况 * Tagger: 寻找基因内的tagSNP * tagSNP * * / 大家要是有时间的话，可以尝试在dbSNP数据库中进行SNP检索 dbSNP数据库检索SNP 结果显示，点击 GeneView 输入查询 * 选in gene region, 显示IL10内所有的SNP； 选cSNP,显示编码区域的SNP * 注意： dbSNP数据库中SNP数量很大，有的没有经过验证，研究时仅作参考 想想red、green区域的区别？ * r missense, Val Ile * 思考题 结合本章的介绍和前几章的知识，设计一个基于SNP的通路与疾病相关性的实验设计，并分析其可行性 * THANKS！ * 单核苷酸多态与人类疾病SNPs In Human Diseases * 回顾理论课内容 单核苷酸多态性及相关概念 常用的SNP分型技术 基于SNP的复杂疾病遗传定位方法 1 2 重要的SNP数据库资源 3 4 * * 实习课内容 1. 利用HapMart网络平台提取中国汉族人群基因IL8上的SNP，并列出这些SNP各自所处的功能区域 2. 试结合第一章中对NCBI等重要的序列数据资源知识介绍，选取适当的限制性片段长度多态性方法用于IL8基因上SNP分型的内切酶 * 实习课内容 3. 从本章给出的Haplovie