2.2-遗传的物质基础-副本选编.ppt

2.2 DNA 的结构 大连大学生物工程学院 迟彦 2.2.1 DNA一级结构 核酸是以单核苷酸为基本结构单位，通过3’，5’ -磷酸二酯键形成的链状多聚体，单核苷酸是由含氮碱基、戊糖、磷酸基团构成。 核酸又分为DNA和RNA二种。 DNA是由碱基（A、T、C、G）、脱氧核糖、磷酸基团组成。RNA是由碱基（A、U、C、G）、核糖、磷酸基团组成。 DNA一级结构 核酸的一级结构就是指四种核苷酸的连接及其排列顺序，表示了该核酸分子的化学构成。 分子组成： —— 碱基(base)：嘌呤碱，嘧啶碱 —— 戊糖(ribose)：核糖，脱氧核糖 —— 磷酸(phosphate) 不同生物的DNA碱基组成有明显的差异，表明物种的特异性 同一生物的不同组织与不同发育阶段的DNA却没有特异性，表明各种生物的碱基组成是稳定的 2.2.2 DNA的二级结构 DNA的二级结构，是指两条多核苷酸链反向平行盘绕所生成的双螺旋结构。 在生物活体中，不论DNA的二级结构还是高级结构，都是时刻变化的，即在二级结构的各种构象间、在二级结构与高级结构的各种构象间存在一个动力平衡。 通常情况下，DNA的二级结构分两大类：一类是右手螺旋，如A-DNA和B-DNA等；另一类是左手螺旋，即Z-DNA。 Watson和Crick所用的资料来自相对湿度为92%时所得到的DNA钠盐纤维。这种DNA称为B型DNA。很早人们就知道DNA可以以多种形式的双螺旋结构存在，双螺旋的构象现已知有A、B、C、D、E、T、Z七种。 引起DNA双链构象改变有以下因素： ①核苷酸顺序； ②碱基组成； ③盐的种类和浓度； ④相对湿度。 当溶液环境发生适当的改变时，这些构象之间可以发生相互转化,而且在每种构象家族中，参数会有轻微的变化。 B-DNA DNA分子是由两条反向平行的脱氧核苷酸链围绕同一中心轴相互盘绕而成，形成双螺旋结构，主链位于螺旋的外侧，而且两条链的5’和3’方向相反。 DNA分子中的脱氧核糖和磷酸通过3’，5’-磷酸二酯键交替连接，排在外侧，构成基本骨架，两条链碱基通过氢键形成碱基对，使两条链连在一起，碱基对的平面与轴线垂直。 碱基配对时，必须是嘌呤和嘧啶配对，即遵循A=T，G≡C，T=A，C≡G的碱基互补配对原则。 双螺旋平均直径为2nm，螺距为3.4nm，上下相邻碱基之间的垂直距离为0.34nm，两个相邻碱基对之间绕螺旋轴旋转的角度为36°，每个螺旋含10个碱基对。 双螺旋的表面形成两条沟，即大沟和小沟。大沟中碱基的差异很易被识别，是蛋白质结合特异DNA序列的位点，对于蛋白质识别DNA双螺旋结构上的信息非常重要。 小沟也可结合蛋白质，但结合的少。 DNA的种类及其手性-A-DNA 相对湿度为75%以下 DNA-RNA杂交分子、 RNA－RNA双链结构均采取A构象。 对基因表达具有重要意义 Z-DNA 1972年Pohl等发现人工合成的嘌呤与嘧啶相间排列的多聚核苷酸顺序d(GCGCGC)在高盐的条件下，旋光性会发生改变。 接着Wang A.H.J.（王惠君）和A.Rich对六聚体d(CGCGCG)单晶体作了分辨率达0.09nm的X衍射分析，提出了Z-DNA模型。在d(CGCGCG)晶体上，磷酸核糖骨架呈Z字形走向。所以称为Z-DNA。 Z-DNA并不只限于GC相间的DNA顺序中，在双螺旋多核苷酸链中，只要嘌呤和嘧啶碱基交替排列，在一定的条件下(如高盐浓度)，都有可能出现Z构象。 2.2.3 DNA的高级结构 DNA的高级结构是指DNA双螺旋进一步扭曲盘绕所形成的特定空间结构。超螺旋结构是DNA高级结构的主要形式。可分为正超螺旋，负超螺旋 DNA的三级结构-超螺旋 DNA双螺旋结构中，一般每转一圈有10个核苷酸对，双螺旋总处于能量最低状态。若正常DNA双螺旋额外地多转或少转几圈，使每转一圈的核苷酸数目大于或小于10，就会出现双螺旋空间结构的改变，在DNA分子中产生额外的张力。 如果双螺旋末端是开放的，这种张力可以通过链的转动而释放出来，使DNA恢复正常的双螺旋状态。 但在共价闭合环状DNA或与蛋白质结合的DNA中，DNA分子两条链不能自由转动，这些额外的张力不能释放到分子之外，导致DNA分子扭曲以缓解这种张力。DNA分子的这种扭曲就称为超螺旋 正超螺旋 正超螺旋：对于右手螺旋DNA分子来说，如果每圈初级螺旋的碱基对数小于10bp，则其二级结构处于紧缠的状态，由此产生的超螺旋就是正超螺旋。螺旋部分为左手螺旋。 负超螺旋 负超螺旋：如果每圈初级螺旋的碱基对数大于10bp，则其二级结构处于松缠的状态，由此产生的超螺旋就是负超螺旋。螺旋部分为右手螺旋。 超螺旋总是要向着抵消初级螺旋 改变的方向发展。 L=T+W 公式 L：连接数（li