Fido, a Novel AMPylation Domain Common to Fic, Doc, and AvrB 英文参考文献.docVIP

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2017-05-11 发布于上海
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Fido, a Novel AMPylation Domain Common to Fic, Doc, and AvrB 英文参考文献.doc

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Fido, a Novel AMPylation Domain Common to Fic, Doc, and AvrB 英文参考文献

Fido,aNovelAMPylationDomainCommontoFic,Doc, andAvrB LisaN.Kinch1*,MelanieL.Yarbrough3,KimOrth3,NickV.Grishin1,2 1HowardHughesMedicalInstitute,UniversityofTexasSouthwesternMedicalCenter,Dallas,Texas,UnitedStatesofAmerica,2DepartmentofBiochemistry,Universityof TexasSouthwesternMedicalCenter,Dallas,Texas,UnitedStatesofAmerica,3DepartmentofMolecularBiology,UniversityofTexasSouthwesternMedicalCenter,Dallas, Texas,UnitedStatesofAmerica Abstract Background:TheVibrioparahaemolyticustypeIIIsecretedeffectorVopScontainsaficdomainthatcovalentlymodifiesRho GTPasethreoninewithAMPtoinhibitdownstreamsignalingeventsinhostcells.TheVopSficdomainincludesaconserved sequencemotif(HPFx[D/E]GN[G/K]R)thatcontributestoAMPylation.Ficdomainsarefoundinavarietyofspecies,including bacteria,afewarchaea,andmetazoaneukaryotes. Methodology/PrincipalFindings:WeshowthattheAMPylationactivityextendstoaeukaryoticficdomaininDrosophila melanogasterCG9523,andusesequenceandstructurebasedcomputationalmethodstoidentifyrelateddomainsindoc toxins and the type III effector AvrB. The conserved sequence motif that contributes to AMPylation unites fic with doc. Although AvrB lacks this motif, its structure reveals a similar topology to the fic and doc folds. AvrB binds to a peptide fragmentofitshostvirulencetargetinasimilarmannerasficbindspeptidesubstrate.AvrBalsoorientsaphosphategroup fromaboundADPligandnearthepeptide-bindingsiteandinasimilarpositionasaboundficphosphate. Conclusions/Significance:ThedemonstratedeukaryoticficdomainAMPylationactivitysuggeststhattheVopSeffectorhas exploitedanovelhostposttranslationalmodification.Ficdomain-relatedstructuresgiveinsighttotheAMPylationactive siteandtotheVopSficdomaininteractionwithitshostGTPasetarget.Theseresultssuggestthatfic,doc,andAvrBstem fromacommonancestorthathasevolvedtoAMPylateproteinsubstrates. Citation:KinchLN,YarbroughML,OrthK,GrishinNV(2009)Fido,aNovelAMPylationDomainCommontoFic,Doc,andAvrB.PLoSONE4(6):e5818.doi:10.1371/ journal.pone.0005818 Editor:BostjanKobe