Genome-Wide Association Analysis of Autoantibody Positivity in Type 1 Diabetes Cases 英文参考文献.docVIP

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2017-05-11 发布于上海
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Genome-Wide Association Analysis of Autoantibody Positivity in Type 1 Diabetes Cases 英文参考文献.doc

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Genome-Wide Association Analysis of Autoantibody Positivity in Type 1 Diabetes Cases 英文参考文献

Genome-WideAssociationAnalysisofAutoantibody PositivityinType1DiabetesCases VincentPlagnol1*,JoannaM.M.Howson1,DeborahJ.Smyth1,NeilWalker1,JasonP.Hafler1 ,Chris Wallace1,HelenStevens1,LauraJackson2,MatthewJ.Simmonds3,Type1DiabetesGenetics Consortium,PollyJ.Bingley4,StephenC.Gough3,JohnA.Todd1* 1Juvenile Diabetes Research Foundation/Wellcome Trust Diabetes and Inflammation Laboratory, Department of Medical Genetics, Cambridge Institute for Medical Research,NationalInstituteforHealthResearchBiomedicalResearchCentre,UniversityofCambridge,Cambridge,UnitedKingdom,2UniversityHospitalsBirmingham, Birmingham,UnitedKingdom,3TheOxfordCentreforDiabetes,Endocrinology,andMetabolism,ChurchillHospital,Headington,Oxford,UnitedKingdom,4Schoolof ClinicalSciences,UniversityofBristol,Bristol,UnitedKingdom Abstract The genetic basis of autoantibody production is largely unknown outside of associations located in the major histocompatibility complex (MHC) human leukocyte antigen (HLA) region. The aim of this study is the discovery of new genetic associations with autoantibody positivity using genome-wide association scan single nucleotide polymorphism (SNP)dataintype1diabetes(T1D)patientswithautoantibodymeasurements.Wemeasuredtwoanti-isletautoantibodies, glutamate decarboxylase (GADA, n=2,506), insulinoma-associated antigen 2 (IA-2A, n=2,498), antibodies to the autoimmune thyroid (Graves’) disease (AITD) autoantigen thyroid peroxidase (TPOA, n=8,300), and antibodies against gastricparietalcells(PCA,n=4,328)thatareassociatedwithautoimmunegastritis.Twolocipassedastringentgenome- widesignificancelevel(p,10210):1q23/FCRL3withIA-2Aand9q34/ABOwithPCA.Elevenof52non-MHCT1Dlocishowed evidenceofassociationwithatleastoneautoantibodyatafalsediscoveryrateof16%:16p11/IL27-IA-2A,2q24/IFIH1-IA-2A and PCA, 2q32/STAT4-TPOA, 10p15/IL2RA-GADA, 6q15/BACH2-TPOA, 21q22/UBASH3A-TPOA, 1p13/PTPN22-TPOA, 2q33/ CTLA4-TPOA, 4q27/IL2/TPOA, 15q14/RASGRP1/TPOA, and 12q24/SH2B3-GADA and TPOA. Analysis of the TPOA-a