Global Entrainment of Transcriptional Systems to Periodic Inputs 英文参考文献.docVIP

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2017-05-11 发布于上海
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Global Entrainment of Transcriptional Systems to Periodic Inputs 英文参考文献.doc

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Global Entrainment of Transcriptional Systems to Periodic Inputs 英文参考文献

GlobalEntrainmentofTranscriptionalSystemsto PeriodicInputs GiovanniRusso1,MariodiBernardo1,2*,EduardoD.Sontag3* 1DepartmentofSystemsandComputerEngineering,UniversityofNaplesFedericoII,Naples,Italy,2DepartmentofEngineeringMathematics,UniversityofBristol,Bristol, UnitedKingdom,3DepartmentofMathematics,RutgersUniversity,Piscataway,NewJersey,UnitedStates Abstract Thispaperaddressestheproblemofprovidingmathematicalconditionsthatallowonetoensurethatbiologicalnetworks, suchastranscriptionalsystems,canbegloballyentrainedtoexternalperiodicinputs.Despiteappearingobviousatfirst,this isbynomeansagenericpropertyofnonlineardynamicalsystems.Throughtheuseofcontractiontheory,apowerfultool fromdynamicalsystemstheory,itisshownthatcertainsystemsdrivenbyexternalperiodicsignalshavethepropertythat alltheirsolutionsconvergetoafixedlimitcycle.Generalresultsareproved,andthepropertiesareverifiedinthespecific casesofmodelsoftranscriptionalsystemsaswellasconstructsofinterestinsyntheticbiology.Aself-containedexposition ofallneededresultsisgiveninthepaper. Citation: Russo G, di Bernardo M, Sontag ED (2010) Global Entrainment of Transcriptional Systems to Periodic Inputs. PLoS Comput Biol 6(4): e1000739. doi:10.1371/journal.pcbi.1000739 Editor:HerbertM.Sauro,UniversityofWashington,UnitedStatesofAmerica ReceivedJuly6,2009;AcceptedMarch12,2010;PublishedApril15,2010 Copyright: ? 2010 Russo et al. This is an open-access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricteduse,distribution,andreproductioninanymedium,providedtheoriginalauthorandsourcearecredited. Funding:GRandMdBacknowledgesupportfromtheEuropeanUnionProject‘EngineeringComplexityinBiologicalSystems(COBIOS)’,VIFrameworkprogram (Grant no.043379).EDS acknowledges support fromgrants NSF-DMS-0614371, NIH-1R01GM086881, andAFOSR-FA9550-08. Thefundershad noroleinstudy design,datacollectionandanalysis,decisiontopublish,orpreparationofthemanuscript. CompetingInterests:Theauthorshavedeclaredth