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- 2017-05-13 发布于天津
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代谢组学数据分析的统计学方法.pdf
中 2014 4 31 2 期 3·57 ·
国卫生统计 年 月第 卷第
代谢组学数据分析的统计学方法*
柯朝甫1 张 涛2 武晓岩1 李 康1Δ
, (4 ) :
代谢组学是近年发展快速的一门学科 目前在医 相互作用关系复杂 各种代谢物质可能不仅
、 、 、 、 , ,
学 植物学 微生物学 毒理学 药物研发等诸多领域中 具有简单的相加效应 而且可能具有交互作用 从而增
[1-5]
得到了广泛的应用 。代谢组学研究产生大量的数 加了识别这些具有复杂关系的生物标志物的难度。
, 、 、 。 (5) : ,
据 这些数据具有高维 小样本 高噪声等复杂特征 相关性和冗余性 各种代谢物并非独立存在
, , 、
如何从复杂的代谢组学数据中提取出有价值的信息 而是相互之间具有不同程度的相关性 同时由于碎片
筛选出潜在的生物标志物成为近年来代谢组学研究的 加合物和同位素的存在使得数据结构存在很大的冗余
。 , ,
热点和难点 据此 本文针对目前代谢组学数据分析 性 这就需要采用合理的统计分析策略来揭示隐藏其
中的常用统计学方法及其研究进展进行介绍。 中的复杂数据关系。
(6) :
分布的不规则和稀疏性 代谢组学数据分布
代谢组学数据的特点
, ( ),
不规则 而且数据具有稀疏性 即有很多值为零 因
代谢组学是系统生物学领域中继基因组学和蛋白 , 。
此 传统的一些线性和参数分析方法此时可能失效
,
质组学之后新近发展起来的一门学科 它通过检测生
数据的预处理
物体在受到外源刺激或基因修饰后其体内代谢物质的
[6]
变化来探索整个生物体的代谢机制 。其研究对象 代谢组学数据分析的目的是希望从中挖掘出生物
( < , , ,
为生物体内所有内源性小分子代谢物 分子量 相关信息 然而 代谢组学数据的变异来源很多 不仅
1000Da), , 。
研究手段为高通量检测技术和数据处理方
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