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- 2017-05-14 发布于天津
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利用创新生物信息学工具对基于二代测序技术
(NGS)发现的变异进行Sanger测序验证
摘要
二代测序(NGS)分析已经彻底改变了我们对于生物过程的理解。 的数据精度高且容易解读因此被认为是DNA序列分析的金标准。
在许多基础科学或应用科学研究中,通过比较不同群体研究对象 因此CE是用来验证在NGS平台上读出的变异的理想系统。为了
的原始DNA序列而获得了很多的进展。在这些研究中,研究人员 简化验证流程我们开发了一种基于网络的引物设计工具,适用于
试图找出群体间核酸序列的变异在疾病易感性、疾病进展或表型 进行PCR和Sanger测序,它基于以一种易于搜索的方式提供了
变异中发挥的作用。 针对于人类基因组上几乎所有外显子的预设计PCR引物对。使用
这些引物,研究者可以直接对由NGS发现的目标变异进行PCR
因此准确识别序列变异将有助于确保实验结果的成功。但是,由 扩增及Sanger测序。由此获得的Sanger测序结果数据(.ab1 files)
于NGS技术中使用的文库制备方法和试剂易产生低水平但可检测 可以使用一种新的被称为NGC(二代验证) 的软件对其进行分析并
的测序误差,因而会造成对实验结果的混乱或错误的解读。
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