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- 2017-05-14 发布于湖北
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西北农林科技大学生命学院大三上基因工程
西北农林科技大学 基因工程实验报告 GAPDH截短体重组与表达
实验及仪器:
高速冷冻离心机、低温冰箱、液氮罐、研钵、剪刀、镊子、PCR扩增仪、台式离心、恒温水浴锅、微量移液器、培养皿、带帽试管、涂布器、无菌操作台(含酒精灯、接种环、灭菌牙签等)、恒温摇床、1.4ml EP 管、培养皿、电转印、摇床、紫外灯、恒温水浴箱、电泳仪系统、凝胶成像系统等
实验步骤:
小麦总 RNA 提取(Trizol 法)
材料:小麦幼苗
试剂配制及器具处理
0.1%的 DEPC H2O(DEPC:焦碳酸二乙酯)
器具处理:试剂瓶、量筒、研钵、大小枪头和 1.5ml 和 0.2ml 的 EP 管等用纱布刀、镊子和药匙等 160℃烘烤 6h 以上。
无 RNA 酶灭菌水(DEPC H2O):用将高温烘烤的玻璃瓶 (180℃×2h)装蒸馏水,然后加入 0.1%的 DEPC(体积/体积),处理过夜后高压灭菌。
Trizol 试剂
75% DEPC 处理过的水配制 75%乙醇(用高温灭菌器皿配制),然后装入高温烘烤的玻璃瓶中,存放于低温冰箱。
氯仿(最好用新的)。
异丙醇(最好用新的)。
操作步骤
Trizol 法提取总 RNA
先在研钵中加入液氮,再将小麦叶片剪成小段在液氮中磨成粉末,用液氮预冷的药匙取 50~100mg 组织粉末加入已盛有 1ml 的 Trizol 液的 EP 管中(注意研磨粉末总体积不能超过所用 Trizol 体积的 10%),充分混合均匀。
室温放置 5min,然后加入 200μL 的氯仿,盖紧 EP 管并剧烈摇荡 15 秒钟。
12000rpm 离心 10min,取上层水相于一新的 EP 管中 (千万不要将中间的沉淀层和下层液混入,否则重新离心分离),加入 500μL 异丙醇,温和颠倒混匀。室温放置 10min,12000rpm 离心 10min。
小心地弃去上清液,加入 1ml 的 75%乙醇,涡旋混匀,4℃下 12000rpm 离心 5min。
重复步骤④。
弃去上清液(尽量将残余液体除去),室温或真空干燥 5~10min (注意不要干燥过分,否则会降低 RNA 的溶解度)。用 30μL DEPC 处理过的水将 RNA 溶解,必要时可 55℃~60 ℃水浴10 min。RNA 可进行 mRNA 分离,或贮存于 70%乙醇并保存于-70℃。
[注意]
整个操作要带口罩及一次性手套,并尽可能在低温下操作。
加氯仿前的匀浆液可在-70℃保存一个月以上RNA 沉淀在70%,乙醇中可在 4℃保存一周,-20℃保存一年。
RT-PCR 扩增目的基因 cDNA
试剂
RNA 模板
Olig (dT)18
反转录缓冲液
dNTP
M-MULV 反转录酶
RNA 抑制剂(RNasin)
Premix EX Taq DNA 聚合酶
PCR 特异引物
操作步骤
RNA 的反转录
采用 Thermo Scientific (Fermentas) RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit
6μL(需加入 RNA 约 1(g) Total RNA 1μL Oligo dT primer 5μL H2O(nuclease-free) 12μL 65℃ 5min,补加下列试剂: 5× Reaction buffer 4μL Ribolock RNase Inhibitor 1μL 10mM dNTP Mix 2μL RevertAid M-MuLV Reverse Transcriptase 1μL 20μL 42℃ 60min 70℃,5min,-20℃保存 PCR 扩增目的基因
用表达引物扩增目的基因(25μL 体系)
2×PCR Mix 12.5 cDNA 1 引物 GAPDH1-1 1 引物 GAPDH1-2 1 ddH2O 9.5 total 25μL PCR程序:
95℃ 1min
95℃ 10s
58℃ 20s 35cycles
72℃ 45s
72℃ 10min
16℃
PCR产物进行电泳并做胶回收
核酸琼脂糖电泳分析
试剂
TAE 缓冲液(50×):用时需稀释 50 倍
点样缓冲液 Loading buffer(10×):含 0.25%溴酚蓝和 40%甘油
溴乙啶染色液(EB):10mg/ml 溴乙啶,注意 EB 具致癌作用。
琼脂糖
操作步骤
琼脂糖凝胶的制备
称 1g 琼脂糖加入 100ml TAE 缓冲液中加热熔化。
胶板制备
将凝胶槽清洗干净,在一端插好梳子。然后倒入熔化好的琼脂糖,待凝胶完全凝固后,将凝胶槽移至电泳槽(槽中已加入 TA
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