2012年生物化学免费辅导班蛋白质经典习题.pdfVIP

第一部分 经典习题 1.判断氨基酸所带的净电荷，用 pI-pH 比pH-pI 更好，为什么？ [答] 当一种氨基酸的净电荷用 q=pI-pH 表达时，若 q 为正值，则该氨基酸带正电荷；若 q 为负值，则该氨基酸带负电荷。q 值的正与负和该氨基酸所带电荷的种类是一致的。如果采 用 q=pH-pI 来表达，则会出现相反的结果，即 q 为负值时，氨基酸带正电荷；q 为正值时， 氨基酸带负电荷。因此，用 pI-pH 更好。 2.甘氨酸是乙酸甲基上的氢被氨基取代生成的，为什么乙酸羧基的 pKa 是 4.75 ，而甘氨酸 羧基的 pKa 是 2.34 ？ [答] 当甘氨酸溶液的pH 低于 6.0 时，氨基以带正电荷的形式存在，带正电荷的氨基通过静 电相互作用（诱导效应）使羧基更容易失去质子，成为更强的酸。 3. （1）Ala ，Ser，Phe ，Leu ，Arg ，Asp ，Lys 和 His 的混合液中pH3.9 进行纸电泳，哪些 向阳极移动？哪些向阴极移动？（2 ）为什么带相同净电荷的氨基酸如Gly 和 Leu 在纸电泳 时迁移率会稍有差别？ [答] （1）Ala ,Ser,Phe 和 Leu 的pI 在 6 左右。在 PH3.9 时，都带净正电荷，所以向阴极移动， 但彼此不能分开；His 和 Arg 的pI 分别是 7.6 和 10.8，在pH3.9 时，它们亦带净正电荷向阴 极移动。由于它们带的正电荷多，所以能和其他向阴极移动的氨基酸分开；Asp 的pI 是 3.0, 在 PH3.9 时，它带负电荷，向阳极移动。（2 ）电泳时若氨基酸带有相同电荷，则相对分子 质量大的移动速度较慢。因为相对分子质量大的氨基酸，电荷与质量的比小，导致单位质量 受到的作用力小，所以移动慢。 4. （1）由20 种氨基酸组成的 20 肽，若每种氨基酸残基在肽链中只能出现 1 次，有可能形 成多少种不同的肽链？（2 ）由20 种氨基酸组成的 20 肽，若在肽链的任一位置 20 种氨基酸 出现的概率相等，有可能形成多少种不同的肽链？ 答案: （1）可能的种类数为20 ！≈ ；（2 ）可能的种类数为2020 ≈ 。 5.在大多数氨基酸中， -COOH 的pKa 都接近 2.0 ， -NH 的pKa 都接近 9.0 。但是，在肽 链中， -COOH 的pKa 为 3.8，而 -NH3 ＋ 的pKa 值为 7.8 。你能解释这种差别吗？ [答] 在游离的氨基酸中，带正电荷的 使带负电荷的-COO-稳定，使羧基成为一种更强的酸。 相反地，带负电荷的羧酸使 稳定，使它成为一种更弱的酸，因而使它的 pKa 升高。当肽形 成时，游离的 -氨基和 -羧基分开的距离增大，相互影响降低，从而使它们的 pKa 值发生变 化。 6. -螺旋的稳定性不仅取决于肽链内部的氢键，而且还与氨基酸侧链的性质相关。室温下， 在溶液中下列多聚氨基酸哪些能形成 螺旋？哪些能形成其他有规则的结构？哪些能形成无 规则的结构？并说明其理由。（1）多聚亮氨酸pH7.0 ；（2 ）多聚异亮氨酸pH7.0 ；(3) 多 聚精氨酸 pH7.0 ；(4) 多聚精氨酸pH13.0 ； （5 ）多聚谷氨酸pH1.5 ； (6) 多聚苏氨酸pH7.0 ； (7) 多聚羟脯氨酸pH7.0. [答] （1）多聚亮氨酸的R 基团不带电荷，适合于形成 -螺旋。（2 ）异亮氨酸的 -碳位上有 分支，所以形成无规则结构。（3 ）在pH7.0 时，所有精氨酸的R 基团带正电荷，由于静电 斥力，使氢键不能形成，所以形成无规则结构。（4 ）在pH13.0 时，精氨酸的R 基团不带 电荷，并且 -碳位上没有分支，所以形成 -螺旋。（5 ）在pH1.5 时，谷氨酸的R 基团不带 电荷，并且 -碳位上没有分支，所以形成 -螺旋。（6 ）因为苏氨酸 -碳位上有分支，所以不 能形成 -螺旋。（7 ）脯氨酸和羟脯氨酸折叠成脯氨酸螺旋，这是一种不同于 -螺旋的有规 则结构。 7.球蛋白的相对分子质量增加时，亲水残基和疏水残基的相对比例会发生什么变化？ [答] 随着蛋白质相对分子质量（Mr ）的增加，表面积与体积的比率也就是亲水残基与疏水 残基的比率必定减少。为了解释这一点，假设这些蛋白质是半径为 r 的球状蛋白质，由于蛋 白质Mr 的增加，表面积随r2 增加而增加，体积随 r3 的增加而增加，体积的增加比表面积 的增加更快，所以表面积与体积的比率减少，因此亲水残基与疏水残基的比率也就减少。 8.血红蛋白 亚基和 亚基的空