微生物分类和鉴定.ppt

（2）在分类学文献中 学名=属名+种名+（首次定名人）+现名定名人+现名定名年份 必要（斜体） 可省略（正体） （3）三名法 有亚种或变种时，学名由“三名法”构成 学名=属名 + 种名加词 + subsp 或 var + 亚种或变种的加词 斜体 正体（可省略） 斜体（不可省略） 三、微生物分类鉴定的方法 菌种鉴定步骤： 获得纯培养物 测定必要的鉴定指标 查找权威性的菌种鉴定手册 分类鉴定方法： 经典分类鉴定法 微生物遗传型的鉴定 细胞化学成分的鉴定 现代方法 数值分类法 在生物学表型为指标的传统方法，正在向微量化、简便化、快速化、智能化的方向发展。目前，已有商品化的鉴定系统，如： API系统 “Enterotube” “Biolog”全自动和手动系统 按大量表型性状的相似性程度进行统计、归类 特点: 使用尽可能多的性状，每个性状同等重要。 步骤: (1) 收集菌株，选择性状 (2) 性状编码 (3) 相似性计算: 计算相关系数Ssm或Sj： Ssm=（a+c）/(a+b+c) 正负反应性状 Sj=a/(a+b+c) 正反应性状 Sj 80~85% 种 Sj 65% 属 (4)系统聚类 (5)聚类结果的表示 3. 细胞化学成分用作鉴定的指标 细胞壁的化学成分 全细胞水解液的糖型 磷酸类脂成分的分析 枝菌酸的分析 醌类的分析 气相色谱技术（脂肪酸组成和代谢产物分析） 本章重点 1. 分类单元（七级） 种是基本的分类单位 2. 命名 1）学名的国际命名法则——双名法 2）常见微生物的学名 3. 分类鉴定的方法和指标 4. 分类系统 一些生物大分子（如16SrRNA或18SrRNA），其分子序列的改变量与分子进化的时间成正比，因此，这些生物大分子被作为分子计时器，真实记录了各种生物的进化过程。可通过比较不同类群的生物大分子序列的改变量来确定它们彼此系统发育的相关性或进化距离。 分子计时器： （4） 微生物全基因组序列测定 第一个古菌：詹氏甲烷杆菌 第一个细菌：流感嗜血杆菌 第一个真菌：酿酒酵母 《伯杰氏鉴定细菌学手册》 (Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology) 第一版（1923年）~ 第八版（1974年） ~ 第九版（1994年） 美国宾夕法尼亚大学的细菌学教授伯杰(D.Bergey) 主编。 1957年第七版后，吸收了国际上细菌分类学家参加编写，它的近代版本反映了出版年代细菌分类学的最新成果，因而逐渐确立了在国际上对细菌进行全面分类的权威地位。 四. 分类系统 1. 原核生物分类系统 1984~1989年 改为《伯杰氏系统细菌学手册》，简称《系统手册》 (Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology) （第一版，分四卷） 第二版，分五卷 （根据系统发育资料，对分类单元进行了相当大的调整，将细菌分成两个域共25门39纲） 第一卷：古生菌、蓝细菌、光合细菌以及最早分支的细菌 第二卷：变形杆菌（包括形态及生理学特征多样的革氏阴性菌） 第三卷：低G+C含量的革氏阳性菌 第四卷：高G+C含量的革氏阳性菌 第五卷：浮霉状菌、螺旋体、丝杆菌、拟杆菌和衣原体等 伯杰氏手册是目前进行细菌分类、鉴定的最重要依据，其特点是描述非常详细，包括对细菌各个属种的特征及进行鉴定所需做的实验的具体方法。 2. 菌物分类系统 Ainsworth菌物系统（ Ainsworth’s system of fungi） 第七版(1983年) 第八版(1995年) 影响力较大 * * 第十章 微生物分类与鉴定 本章内容 一、分类单元 二、命名规则 三、分类鉴定方法 四、微生物的分类系统 据保守估计，地球上 真菌约150万种，细菌4万种，病毒130万种 但认识的微生物仅是估计数量的5~10%，即15万~20万种 要认识、研究和利用类群庞大的微生物资源， 必须对它们进行分类。 分类(classification)：根据一定的原则(表型特征相似性或系统发育相关性)对微生物进行分群归类，根据相似性或相关性水平排列成系统，并对各个分类群的特征进行描述，以便查考和对未被分类的微