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蛋白质的结构和功能PPT
5. 克-雅病变种(variant CJD, v-CJD):一种新型的人类传染性海绵状脑病,1996年由英国CJD监测中心首次报导。本病与典型的CJD在好发年龄、临床特征、脑电图和病理等方面有明显变化,因此被认为是新变种(new variant CJD, v-CJD)。进一步的研究结果显示,从这些病例中提取的PrPSC与来源于BSE的PrPSC的性质相同,患者脑组织的病理变化与BSE相似,从而表明v-CJD与疯牛病密切相关。现在普遍认为v-CJD的来源可能是人食物链中含有疯牛病的致病因子所致,但确切的致病机制尚不清楚。BSE和v-CJD的出现已受到国际社会的广泛关注。 淀粉样变性病 球状蛋白形成淀粉样蛋白的一个可能机制 约20种淀粉样变性病,包括阿尔海默病,帕金森氏症和II型糖尿病。 阿尔茨海默病(老年性痴呆):大脑细胞退化萎缩,2个和AD有关的蛋白质:β淀粉样蛋白和Tau蛋白,在病变时发生聚集。这些蛋白质在病变时的一个共同特点是,分子中β折叠增加,进而导致分子聚集,对蛋白水解酶的抗性增大。 (四)空间结构测定 X射线晶体分析法 核磁共振(NMR)波普法 X射线晶体分析法步骤 NMR波谱法步骤 X射线衍射法(X-ray diffraction,XRD) 到目前为止,研究蛋白质高级结构的方法仍然是以X射线衍射法原理是:当X射线投射到蛋白质晶体样品时,蛋白质分子内部结构受到激发,入射线反射波互相叠加产生衍射波,衍射波含有被测蛋白质构造的全部信息,通过摄影即可得一张衍射图(diffraction pattern),再用电脑进行重组,即可绘出一张电子密度图(electron density map)。从电子密度图可以得到样品的三维分子图象,即分子结构的模型。 X射线衍射原理 X-RAY DIFFRACTION研究蛋白质的立体结构 1936年Max F. Perutz开始用X-光衍射技术来研究血红蛋白的立体结构; 1945年Perutz的学生J. C. Kendrew开始研究肌红蛋白的结构; 1957年肌红蛋白的结构确定, 1959年血红蛋白结构解明; 两人于1962年获得诺贝尔化学奖。 Kendrew Perutz L. Braggs 核磁共振波谱学(nuclear magnetic resonance, NMR) 1971年Jeener(比利时)提出二维核磁共振的概念,1985年Kurt在此基础上发明了一种新方法,他选择生物大分子中的质子(氢原子核)作为测量对象,连续测定所有相邻的两个质子之间的距离和方位,这些数据经计算机处理后就可形成生物大分子的三维结构图。用此方法他测定了一个蛋白质的三维结构,奠定了NMR作为蛋白质结构研究方法的重要手段,因此获得2002年诺贝尔化学奖。现在NMR已成为生物大分子溶液三维结构研究的主要手段。 核磁共振是确定蛋白质分子在溶液中的动态结构的唯一方法 Kurt Wuthrich,瑞典科学家2002年获得诺贝尔奖 NMR 技术在蛋白质- 蛋白质、蛋白质-DNA 等分子间的相互作用方面,具有高分辨率的特点,仅次于X- 射线晶体学技术,可以在溶液中操作,在近似蛋白质生理环境下测定其结构,甚至可以对活细胞中的蛋白质进行分析,获得“活”的蛋白质结构。NMR 技术在分析蛋白质折叠稳定性、运动性和蛋白质复合体中各亚基的相互作用方面具有优势。 NMR缺点是只能测定小蛋白和中等大小的蛋白质分子(MW 30 000 以下),并且图谱分析工作极为费时,往往需要数月到一年的时间,导致实验周期延长,速度缓慢;另外核磁共振衍射技术的反应是在溶液中进行的,研究对象必须是可溶的蛋白,对不溶蛋白的研究就比较困难;而且样品需要啊等,这些在一定程度上制约了NMR 技术的应用。 蛋白质空间结构的不同表述形式 a.金属丝图表示主链走向 b.彩带图突出二级结构元 件 c.球棍模型显示氨基酸的 相互作用细节 d.实心球,非氢原子显示 为范德华半径大小的球 e.表面表示法显示蛋白质 表面的拓扑学结构 六、从顺序到结构 深入研究某个蛋白质的功能, 不仅需要进行体外试验,还需要进行体内的细胞生物学实验和突变体研究。要在生物化学、细胞和机体的水平上精确的确定一个蛋白质的功能,需要涉及电子传递、质子传递、酶促反应、蛋白质合成/细胞分裂、胚胎发育等不同水平上的研究。 1.序列对位排列和比较 序列对比为确定蛋白质间关系提供了一种方法 两相对位排列(人Erk2和酵母kss) 多重序列对位排列(Pfam数据库蛋白激酶域) 系统发生树 蛋白质超家族成员之间的距离 MAP激酶三个亚类:ERK、JNK、p38进化上具有高度保守性 2.蛋白质特征集 蛋白质结构的数据有助于通过序列比对来寻找相关的蛋白质 具有跨越
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