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第10章真核生物基因表达的调控
第10章 真核生物基因表达的调控 1、真核生物与原核生物的调控差异 2、真核生物调控的多层次性 3、真核基因表达调控的环节 DNA水平:基因数量,结构 转录水平:顺式作用元件与反式作用因子 转录后水平:mRNA的加工成熟 翻译水平:起始复合物及mRNA稳定性 翻译后水平:蛋白质加工修饰 DNA水平的调控 1)开放型活性染色质与基因活性 (结构) 2)基因组的改变(数量) 1. 真核生物的基因家族 在原核细胞中,密切相关的基因往往组成操纵子,并且以多顺反子mRNA的方式进行转录,整个系统被置于一个启动子的控制之下; 真核细胞的DNA是单顺反子结构,很少有置于一个启动子的控制之下操纵子结构; 真核细胞中许多相关的基因按功能成套组合,被称为基因家族(gene family)。 简单多基因家族:以串联方式前后相连,如rRNA基因; 复杂多基因家族:一般由几个基因家族构成,基因家族之间由间隔序列隔开,并作为独立的转录单位; 发育调控的复杂多基因家族:常常是在每个基因家族中,基因排列的顺序的就是它们在发育阶段的表达顺序。 3. 真核生物DNA水平上的基因表达调控 在个体发育过程中,用来合成RNA的DNA模板也会发生规律性变化,从而控制基因的表达和生物的发育(发育调控) (1) 基因扩增:是指某些基因的拷贝数专一性大量增加。例如,非洲爪蟾的卵母细胞原有rDNA基因500个拷贝,在减数分裂期可以扩增到200万拷贝; (2) 基因重排、变换和剪切:将某些基因从远离启动子的地方移到距启动子很近的位点,从而启动转录,并将多余的等位基因剪切(抗体特异性)。 真核细胞在分化过程中会发生基因重排(gene rearrangement) 3) DNA甲基化 mCpG,即“CpG岛(CpG-rich islands)” DNA甲基化与基因活性的调控 DNA甲基化能关闭某些基因的活性,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。 DNA的甲基化:① 类型: 5-甲基胞嘧啶、N6-甲基腺嘌呤、7-甲基鸟嘌呤;② 出现5-mC的序列: CpG, CpXpG, CCA/TGG和GATC; 关闭基因的机理:甲基化达到一定的程度时会发生B-DNA向Z-DNA的过渡,不利于转录(研究前沿); 例子,DNA甲基化与X染色体失活: Xist基因(产物Xist-RNA是X染色体失活因子)的表达是决定X染色体失活的关键因素。有活性的X染色体上的Xist基因总是甲基化,而失活的X染色体Xist基因都是去甲基化的。♂的唯一X染色体Xist基因都高度甲基化;♀有两条X染色体,活性X染色体上的Xist位点都高度甲基化,而失活X染色体上Xist位点都没有甲基化。 DNA甲基化与X染色体失活 雌性胎生哺乳动物细胞中两条X染色体之一在发育早期随机失活 X染色体失活中心(X-chromosome inactivation center, Xic): Xist基因(Xi-specific transcript) (3) RNA干涉和RNA基因大家族 RNA干涉:1995年康奈尔大学Su Guo发现,给线虫注射正义RNA会特异性地抑制该基因的表达,称为RNA干涉,机制是:形成的双链RNA被酶切为21-25bp的小分子,它们 ① 指导降解同源单链mRNA;② 引导同源DNA甲基化; RNA基因大家族的分类: 真核基因的转录调控 转录的基本条件 转录模板(转录起始点+1---终止点) 启动子(尤其是core promoter) RNA pol Ⅱ 需与20多种蛋白因子结合形成转录复合物 转录因子(TFⅡ)是 RNA pol Ⅱ 基础转录所需的蛋白质因子 同原核一样,真核调控主要发生在转录阶段,主要是通过顺式作用元件、反式作用因子 与靶基因复杂的相互作用实现的。(重点以mRNA的转录为例) 转录调控的关键 顺式作用元件 反式作用因子 1.顺式作用元件(cis-acting elements) 顺式作用元件 启动子 启动子中的元件可以分为两种 增强子 一种能够提高转录效率的顺式调控元件。 沉寂子 最早在酵母中发现 其作用可不受序列方向的影响,也能远距离发挥作用。 2.反式作用因子(trans-acting factors) 以反式作用影响转录的因子可统称为转录因子(transcription factors,TF)。 真核细胞中RNA聚合酶通常不能单独发挥转录作用,而需要与其他转录因子共同协作。 作为蛋白质的转录因子从功能上分析其结构可包含有不同区域: 与DNA结合的转录因子大多以二聚体形式起作用,已知两种常见的 DNA 结合基序为螺旋-转角-螺旋和锌指。 总结:真核基因表达调控的特点 真核基因表达调控的环节更多
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