EMBOSS命令实例-蛋白质序列分析.PDFVIP

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2017-05-24 发布于湖北
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EMBOSS命令实例-蛋白质序列分析.PDF

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EMBOSS命令实例-蛋白质序列分析

EMBOSS pepstats pepstats PPF1_PEA .FASTA PPF 1_PEA.FASTA PEPSTATS of PPF1_PEA from 1 to 442 Molecular weight = 48238.30 Residues = 442 Average Residue Weight = 109.136 Charge = 12.5 Isoelectric Point = 9.9504 Improbability of expression in inclusion bodies = 0.910 Residue Number Mole% DayhoffStat A = Ala 39 8.824 1.026 B = Asx 0 0.000 0.000 C = Cys 1 0.226 0.078 D = Asp 11 2.489 0.452 E = Glu 24 5.430 0.905 F = Phe 19 4.299 1.194 G = Gly 31 7.014 0.835 H = His 5 1.131 0.566 I = Ile 23 5.204 1.156 K = Lys 28 6.335 0.960 L = Leu 50 11.312 1.529 M = Met 6 1.357 0.799 N = Asn 18 4.072 0.947 P = Pro 27 6.109 1.175 Q = Gln 25 5.656 1.450 R = Arg 17 3.846 0.785 S = Ser 42 9.502 1.357 T = Thr 27 6.109 1.001 V = Val 31 7.014 1.063 W = Trp 7 1.584 1.218 X = Xaa 0 0.000 0.000 Y = Tyr 11 2.489 0.732 Z = Glx 0 0.000 0.000 Property Residues Number Mole% Tiny (A+C+G+S+T) 140 31.674 Small (A+B+C+D+G+N+P+S+T