王镜岩-生物化学-第5章蛋白质的三维结构.ppt

台州学院生命科学与医药化工学院 柯世省 一、研究蛋白质构象的方法 共价键与非共价键 蛋白质分子中的共价键有肽键和二硫键，决定蛋白质分子的化学结构（稳定蛋白质构型的作用力）。是生物大分子分子之间最强的作用力，化学物质（药物、毒物等）可以与生物大分子（受体蛋白或核酸）构成共价键。 而非共价键（又称为次级键或分子间力）决定生物大分子和分子复合物的高级结构即决定构象的作用力，在分子识别中起着关键的作用。 共价键和次级键键能对比 肽键 二硫键 离子键 氢键 疏水键 范德华力 （一）酰胺平面与α－碳原子的二面角 肽键的所有4个原子和与之相连的两个 Cα均在同一平面内 C=O与N-H呈反式排列，键长，键角固定 C-N具部分双键性质，不能自由旋转 Cα-N1，Cα-C2单键，可自由旋转 扭角的定义 由四个原子组成的系统 A D B C A—B 与C—D键分别投影在与B—C键相正交的平面上， A—B 与C—D间的夹角称为A与D相对于B—C键的扭角。也可看作ABC平面与BCD平面之间的夹角，记号为θ(Ai,Bj,Ck,Dl )或略记为θ(Bj,Ck ) 量值为±180°（顺时针旋转为正） 当Φ的旋转键Ni-Ciα两侧的Ci-1-Ni和Ciα -Ci呈顺