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第三章生物信息的传递上2009new
第三章 生物信息的传递(上) ——从DNA到RNA ● 基本概念及关键酶 ● 参与转录起始的元件 ● 转录因子 ● 转录的基本过程 ● 转录后加工 ● 原核生物与真核生物mRNA的特征比较 ● RNA合成与DNA合成异同点 ● 其它RNA聚合酶及启动子 (一)、基本概念 生物体以DNA为模板合成RNA的过程 。 参与转录的物质 原料: NTP (ATP, UTP, GTP, CTP) 模板:DNA 酶: RNA聚合酶 其他蛋白质因子 转录的不对称性: 在RNA的合成中,DNA的二条链中仅有一条链可作为转录的模板,称为转录的不对称性。 转录单元(transcription unit) (二)、参与转录起始的关键酶与元件 1. RNA聚合酶 大肠杆菌RNA聚合酶的组成分析 ● 真核生物RNA聚合酶 RNA聚合酶与DNA聚合酶的区别 (一) 启动子(promoter) (二)原核生物启动子结构 原核生物典型启动子的结构 -35 -10 转录起点 TTGACA 16-19bp TATAAT 5-9bp (三)真核生物启动子 真核有三种不同的启动子和有关的元件 启动子Ⅱ最为复杂,它和原核的启动子有很多不同 1.特点 启动子Ⅱ最为复杂,它和原核的启动子有很多不同: (1)有多种元件:TATA框,GC框,CAAT框,OCT等; (2)结构不恒定; (3)它们的位置、序列、距离和方向都不完全相同; (4)有的有远距离的调控元件存在,如增强子; (5)这些元件常常起到控制转录效率和选择起始位点的作 (6)不直接和RNA pol结合; (7) 需多种转录因子介入。 Ⅱ类基因的启动子和调控区 TATA框 核心元件 起始子(initiator,Inr):一般由PY2CAPY5构成, 位于-3~+5 ,可能提供RNA pol Ⅱ识别。 CAAT box、 Ⅱ类启动子 上游元件组成 GC box Oct . 增强子(enhomcer) 远端调控区 减弱子(dehancer) 静息子(sisencer) 上游激活序列(upstream activating seguences UASs) 2.真核生物启动子的结构 (1)、核心启动子 ●定义:指保证RNA聚合酶Ⅱ转录正常起始所必需的、最少的DNA序列,包括转录起始位点及转录起始位点上游TATA区 核心元件 TATA框合又称Hogness框,Goldberg-Hogness 框,俚语 称为金砖(Goldbrick) 其一致序列是:T85A97T93A85A63A83A50 常在-25左右,相当于原核的-10序列。 其作用是: (1) 选择正确的转录起始位点,保证精确起始, 故也称为选择子(selector)。 (2) 影响转录的速率。 (2)、上游启动子元件 ●包括CAAT盒(CCAAT)和GC盒(GGGCGG)等 上游启动子元件(UPE) 表12-4 哺乳动物RNA Pol Ⅱ上游转录因子结合的元 元件 保守序列 结合DNA的长度 蛋白质因子 TATAbox TATAAAA ~10bp TBP CAAT box GGCCAATCT ~22bp CTF/NF1 GC box GGGCGG ~20bp SP1 Octamer ATTTGCAT ~20bp Oct-1 Octamer ATTTGCAT 23bp Oct-2 KB GGGACTTTCC ~10bp NFKB ATF GTGACGT ~20bp ATF B. Lewin:《GENES》Ⅵ.1997,Table 28.2 SV40 早期启动子 组蛋白H2B (3)增强子特点 它是在1981年由Bene
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