张荣娟差异基因.pptVIP

cDNA-AFLP-------差异基因 （所有挑选的差异均为间作处理中特异存在） 代号 基因 推断功能 同源性 RJ2 Conserved protein(氧化还原酶位于同一个操纵元中，还没有关于此基因的研究) 98% RJ4 secA Probable preprotein translocase SecA subunit functions in protein export; 74% RJ6 CgtA和ProB1 Putative GTP-binding protein和Probable glutamate 5-kinase 98% RJ7 prkA PrkA; Putative Ser protein kinase（Signal transductionmechanisms） 76% RJ9 gltA type II citrate synthase:（Citrate synthase activity was essential for nodule maintenance ） 70% RJ14 thiC putative thiamine biosynthesis protein 68% RJ5 fix ? ? RJ12 ? Transcriptional regulator, LysR family 与1021相似性低但与其他物种比对也是这个蛋白 ? 总结----6个差异基因 Q-PCR验证部分差异基因 RJ4 secA RJ6 CgtA RJ6b ProB1 RJ7 prkA RJ9 gltA RJ14 thiC 总结 a b a a b c b a c b a b a a a a b b b b b a c c c JY9（gltA） 文献报道： 根瘤菌突变体中：不能结瘤或形成无效瘤，类菌体减少，胞外多糖比野生型多三倍，推测破坏了侵染线，缺乏能量，对结瘤固氮必须； 大肠杆菌中：突变体生长速度减慢。 a b c JY14---thiC 文献报道： Putative thiamine biosynthesis protein ； 突变体会推迟结瘤； Thiamine is a role during the transition from aerobic to fermentative-like metabolism b a JY4（secA） 文献报道： 细菌特有的一种蛋白质，具有ATP酶活性，是S e c蛋白质转运途径中的“ 动力泵”，通过 ATP的水解循环驱使多肽穿过通道。 c b a JY7（prkA） 文献报道： 丝氨酸蛋白激酶；仅在芽孢杆菌中有报到；是一种cAMP依赖的蛋白激酶作用。 c b a JY6B和JY6（下调） Disruption of the cgtA gene was lethal, demonstrating that this gene is essential for cell growth. secA E.coli and Bacillus 功能已经明确， hydrolyzes ATP and an essential component of the protein translocation ATPase ； SecA Protein的ATP-binding site已经确定； SecA 识别并结合 preprotein-SecB complex, 结合到 inner-membrane anionic phospholipids, 插入 the membrane bilayer 以后，再与the preprotein translocator, SecY/SecE结合，从而将蛋白运输过膜. putative transport protein transmembrane hypothetical protein c b a SecB thiC 文献分布： Sinorhizobium meliloti (2) R.etli(2) E.coli and else(15) Sinorhizobium 突变体库中有关于这个突变体的信息； Rhizobium etli：在其中表达thiCOGE，将增加其固氮效率； Thiamin biosynthesis in prokaryotes：其中涉及12个基因（ thiFSGH, I, and dxs， thiC， thiE， thiD, thiM, thiL, and pdxK） 突变体库查询内容 prkA(1) hypothetical protein SMc01266 Bacillus subtilis ：p