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第9卷 第 1端 生命科学 V0】_9.№ .1
1997年 2月 LifeSciences Feb.,1997
人基因组连锁分析和基因定位
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摘要 连锁分析是确定基因之间连锁关系的统计学方法,是目前进行基因走位的重要手
段。LOD法是最为常用和有效的连锁分析的方法。本文从连锁分析原理、方法和应用成
果及前瞻等三方面进行了介绍。
关键词ji 笪量 型壅坌堡差里塞堡.
分子生物学技术和手段的不断完善和发 要方法。该方法基于在获得关于两个位点的
展,特别是近年来基因组计划实施所积累的 某一份谱系或一份集合谱系资料时,假定这
资料,使系统而迅速地定位和克隆基因特别 两个位点以某一重组率连锁时获得这份资料
是疾病基因成为可能。随着囊性纤维瘤 (Cys— 的概率与假定这两个位点不连锁时获得这份
ticfibrosios,CF)、亨丁顿氏病 (Hunting- 资料的概率相比较,得到支持或反对连锁的
ton’8disease,HD)和乳腺癌 (Breastcancer, 优势 (Odds)。优势对数即指该优势的对数
BRCA)等基因在近年来的被克隆,基于连 (LogofOdds)记为LOD值 (LODScore),用
锁分析的基因定位和定位克隆显示出巨大威 z表示。将获得某份资料的概率用P(data)表
力,在基础和应用两方面都展示了良好的前 示,重组率用 表示,则某一重组率下的LOD
景 值为:
1 连锁分析的原理 z()=log。币P(da而talt~)j
连锁分析是基于基因的连锁关系,来确
定它们的相对位置的方法。随着基因组物理
设有家系,其中父亲为双重杂合子,其
作图和连锁作图的发展,以及连锁分析中对
连锁相有两种可能如附图(见第20页),设两
DNA位标的采用,连锁分析所确定的基因的
位点间的重组率为日, E 0【,0.5】,则当连锁
位置有了较为确定的物理意义。 相 1时,子女中只有个体3为亲本型,4
在人类中进行连锁分析所面临的困难有 5 6、7皆为重组体,此时
两方面:(1)双亲中双重杂合子的连锁相可
能无从得知;(2)两对基因所决定的性状须是 P(data)=K (1一日), K【为常数]
共显性才可根据性状表现发现双重杂合子。
当连锁相2时,情况正相反,3为重组
这些困难使得在 80年代以前对人类所进行
型 其他为亲本型,此时
的连锁分析,实际上处于停滞不前的状态。
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