第3章dna多态性的分子基础一.ppt

教学要求 掌握 1.人类核基因组DNA分类、基因组重复序列类型 2.DNA多态性：DNA长度多态性和序列多态性的概念， VNTR序列和STR序列的特点。 熟悉 DNA分子结构，DNA理化性质；假基因，多基因家族， 转位因子，端粒DNA结构与特征。 了解 基因突变；人类基因组的概况；长度多态性的形成机 制。 第一节 DNA分子结构与功能 一、 DNA的分子结构 二、DNA的理化性质 一、 DNA的分子结构 3. DNA的三级结构----超螺旋结构 定义：双螺旋进一步扭曲形成的更高层次的空间结构。如扭拮、超螺旋等。 特征：核小体(nucleosome)。 意义：压缩DNA分子体积，利于在细胞中的包装。 二、DNA的理化性质 （一）高分子性质 1.较大的黏性，都微溶于水 2.具有两性电解质的性质 中性或弱碱，带负电荷 --- 电泳分离DNA的基础； 与金属离子结合 --- 提取DNA时有助于沉淀DNA。 3.碱基具有共轭双键 紫外线260nm,最大吸收波长 --- DNA初步定量分析 DNA定量分析 –紫外分光光度计法 OD（光密度 optical delnsity）：被检测物吸收掉的光密度。 检测DNA浓度(计算公式略)。 检测DNA纯度：OD260/OD280 ≈ 1.8? (＞2.1,表明有RNA污染；＜1.6，表明有蛋白质、酚等污染） 影响Tm的因素：DNA的均一性; G、C的含量; 介质中的离子强度：低浓度介质中，Tm值低，融链温度的范围窄；高离子强度介质中，DNA分子相对稳定—DNA制品保存在高离子强度介质中。 3.杂交 杂交（hybridization):不同来源的两条核酸单链由于具有互补序列，在一起复性时，互补序列配对，形成杂化DNA分子的过程。 探针（probe）：标记有示踪物的寡核苷酸片段。 基因组（genome）：生物单个成熟生殖细胞(单倍体细胞)DNA分子上的全部基因总和，人类DNA分为核内DNA和线粒体DNA，人类基因组包含核基因组和线粒体基因组。人单个体细胞含有来自父源和母源的两套基因组。 Human Genome 23 Pairs of Chromosomes + mtDNA 基因组学的研究内容 结构基因组学 功能基因组学 蛋白质组学 人类基因组计划大事记 1990，美国国立卫生研究所和能源部投资＄30亿，启动了人类基因组计划，预计15年时间完成人类基因组全部序列的测定； 1996，完成标记密度为0.6cM的人类基因组遗传图谱，100kb的物理图谱； 2000，完成草图； 2001年2月，公布人类基因组图谱的修订版； 2002，完成测序工作。 一、基因与基因有关序列 真核生物---断裂基因 编码序列----外显子( n ) 10%~50% 插入序列----内含子(n-1) 50%~90% 重叠基因（overlapping gene）:由同一DNA序 列可以得到不同的mRNA，从而编码多种具有部 分重叠序列的蛋白质的基因. 二、基因外DNA与重复序列 D1S80：gxxgaccaccagxaag  gaaactggcctccaaacactgcccgccgtccacggccggccggtcctgcgtgtgaatgactcaggagcgtattccccacgcgccagcactgcattcagataagcgctggctcagtgtcagcccaaggaagacagaccacaggcaaggaggaccaccggaaaggaagaccaccggaaaggaagaccaccggaaaggaagaccacaggcaaggaggaccaccggaaaggaagaccaccggcaaggaggaccaccggcaaggaggaccaccaggaaggaggaccaccagcaaggaggaccaccagcaaggaggaccaccaggaaggaggaccaccaggaaggaggaccaccggcaaggaggaccaccaggaaggaggaccaccagcaaggaggaccaccagcaaggaggaccaccaggaaggaggaccaccaggaaggaggaccaccggcaaggaggaccaccaggaaggaggaccaccaggaaggaggaccaccggcaaggaggaccaccaggaaggagaaccaccaggaaggaggaccaccaggaaggaggaccaccaggaaggaggaccactggcaaggaaga