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蛋白质实现功能理论基础 蛋白质结构中的作用力 结构、功能关系 蛋白质一定的结构执行一定的功能,功能不同的蛋白质总是有不同的序列;一级结构相似的蛋白质,其空间构象和功能也相近;若一级结构变化,蛋白质的功能将发生很大的变化。 牛胰核糖核酸酶(RNase)变性和复性的实验是蛋白质结构与功能关系的很好例证。 氧合血红蛋白显著改变Hb的四级结构 图6-10 血红蛋白半分子(αβ二聚体的侧面观) 氧合血红蛋白和去氧血红蛋白代表不同的构象态 (1)T态(紧张态) 和氧的亲和力高,是氧合血红蛋白的形式。 (2)R态(松弛态)和氧的亲和力底,是去氧血红蛋白的形式。 氧与一个处于T态的亚基结合后,转变为R态。原因是稳定T 态的作用力被破坏。 生物体内蛋白质错误折叠 错误折叠蛋白质通常产生三种效应: (1)被细胞防御机制降解,导致功能缺失 (2)发生错误定位,导致细胞功能紊乱 (3)错误折叠蛋白质相互聚集形,成淀粉样沉积物 参考文献 黄积涛. 蛋白质结构、运动、功能. 天津大学博士学位论文 . 2002 胡敏 . 蛋白质结构的空间分布特征研究 . 浙江大学博士学位论文 . 2008 韦日生、王佩蓉、尹长城 . 骨骼肌内质网Ca离子泵装运Ca离子的结构基础 . 生物化学与生物物理进展 . 2006 董彩华、王志强、王延枝 . 大豆液泡膜H+-ATPase功能与构象关系的初步研究 . 生物化学与生物物理进展 . 2000 方慧生、吴梧桐、王旻、余江河、郑珩 . 蛋白质天然构象预测的研究进展 . 中国医科大学学报 . 2005 白晓苏、任伟、张素华 . 血清蛋白组学的最新研究以及应用现状 . 中国临床康复 . 2005 张建国、何彩云、段爱国、殷继艳 . 植物热激蛋白研究进展 . 福建林学院学报 2005 陈岚、许彩民、袁建刚、潘华珍 . 脂筏的结构与功能 . 生物化学与生物物理进展 . 2003 陈明辉、占琦、霍光华 . 错误折叠蛋白质的聚集效应及其对策 . 生命的化学 . 2005 田琨、管娟、邵正中、陈新 . 大豆分离蛋白结构与性能 . 化学进展 . 2008 Beno?t H Dessailly, Marc F Lensink1 and Shoshana J Wodak . Relating destabilizing regions to known functional sites in proteins . BMC Bioinformatics . 2007 Tracey Bray, Pedro Chan, Salim Bougouffa, Richard Greaves, Andrew J Doing and Jim Warwicker . SitesIdentify: a protein functional site prediction tool . BMC Bioinformatics . 2009 Kai Wang, Jeremy A. Horst, Gong Cheng, David C, Nickle, Ram Samudrala . Protein Meta-Functional Signatures from Combining Sequence, Structure, Evolution, and Amino Acid Property Information . Plos computational Biology . 2008 * LOGO Fisher提出的“锁一钥匙”模型(“lock—key”model) Koshand提出的诱导契合模型(induce fitmodel) 100多年前 50多年前 共价键维系了蛋白质的一级结构 主链上的氢键维系了蛋白质的二级结构 氨基酸侧链的相互作用和二硫桥维系三级结构 亚基内部的侧链相互作用是构象稳定的基础 蛋白质链间侧链的相互作用是四级结构的基础 蛋白质侧链与配体基团的相互作用是行使功能的基础 体内各种蛋白质都有特殊的生理功能,这与空间构象有着密切的关系。 肌红蛋门和血红蛋白是阐述空间结构与功能关系的典型例子。 装配接触 α1β1和相同的α2β2接触。涉及螺旋B、G、H和非螺旋段GH拐弯的30多个残基,接触面大,对亚基的装配很重要。当血红蛋白从去氧变为氧合形式时它们不变。 滑动接触 α1β2和相同的α2β1接触。涉及螺旋C、G、H和非螺旋段FG拐弯的19个残基,当血红蛋白因氧合作用而发生构象变化时,这些接触也发生改变。 导致多种神经退行性疾病 研究进展 大豆分离蛋白 热激蛋白 脂筏 由于大豆分离蛋白的组成和构象会对
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