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iCycleriQ荧光定量PCR仪的操作程序
iCycler 荧光定量PCR仪的操作程序
接通iCycler的电源,实验前先让系统预热30分钟。打开电脑,启动iCycler的软件,并点击Yes和OK注册登陆。
在0.2ml的薄壁PCR反应管内加入PCR反应试剂和待测样本,并盖上盖子。注意,必须带一次性塑料手套,不要让手指接触到反应管表面。将反应管按顺序放入仪器的加热孔中。
在Protocol Workshop模块中设置PCR热循环的程序(thermal protocol),包括温度、时间、循环次数等参数的设置。(详见说明书5.1。)
在Protocol Workshop模块中设置反应板设置文件(Plate Setup)。在设置窗口的96孔模拟布局图中选择本次实验使用哪些孔、样品类型(sample type)以及要检测的荧光基团种类。如果样品类型是标准品的话,还要输入其对应的量。全部完成后再点击“View Plate Setup”键,进行确认。(详见说明书5.2。)
确认上一步中选择的滤光镜组是否就位。(详见5.2.5。)完成后按“Run”键。
随后系统自动切换到 “Run Prep”窗口,用户在此确认PCR热循环文件和反应板设置文件是否正确。在“Sample volume is”文件框中输入反应体系的体积;根据本次实验内容在“Identify Protocol Analysis”中选择PCR定量/熔点曲线(PCR Quantification/ Melt Curve);在“Well Factor Source”中选择使用反应板内部矫正(Experimental Plate)。一切都完成后点击“Begin Run”键。
给本次的数据记录文件(opd文件)起名。
PCR循环开始后,系统会打开Run-Time Central模块对实验进行实时监控。当实验进行到荧光收集循环时,Data Analysis模块会自动打开,进行数据的收集和分析。
在实验结束后,在PCR Quantification窗口的“Anlysis Mode”文件框中选择“PCR Base Line Subtracted” 模式选项可得到各样品的Ct值。点击窗口上方的“PCR Standard Curve”窗口选择切换键进入PCR Standard Curve窗口,可得到本次实验的标准曲线。在标准曲线图下方的表格中显示着与其相关的数据,内容包括样品序号、样品类型(Type)、Ct值(Threshold Cycle)、起始模板量(Starting Quanity)等。
实验结束后关闭iCycler软件,光学及扩增系统电源,关闭电脑。
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