第23章-遗传统计-20111226.pdfVIP

《生物医学研究的统计方法》 《生物医学研究的统计方法》 遗传数据基因定位的统计方法简介 郝元涛 2010-12-29 遗传数据基因定位的统计方法简介 1 背 景 • 分子遗传学的最新发展给人类复杂性状的遗传研 究提供了机遇。 • 很多人类疾病，如胰岛素依赖性糖尿病、高血压 以及精神分裂症都认为有遗传成分，确定可能影 响此类疾病的基因位置对病因研究极为重要。 • 基因定位的任务：参照某些已明确位置的遗传标 记来推测某种表型的易感基因在染色体上的位置。 2010-12-29 遗传数据基因定位的统计方法简介 2 关注的目标 • 人类疾病基因组学研究主要关注的目标： • 对那些表型与基因型间并不存在严格一一对应关 系的、更为广泛的复杂遗传学机制的揭示。 2010-12-29 遗传数据基因定位的统计方法简介 3 复杂性状疾病的特点： 1. 遗传模式尚未确定 2. 群体遗传异质性强 3. 外显率低 4. 多基因参与 5. 单一基因作用微弱 6. 受一组环境因素的作用 2010-12-29 遗传数据基因定位的统计方法简介 4 主要方法： • 基因定位的主要理论策略、方法： 1. 基于连锁（linkage ）的分析方法 2. 基于关联（association ）或连锁不平衡（linkage disequilibrium，LD ）的分析方法 2010-12-29 遗传数据基因定位的统计方法简介 5 一、基本概念  基因（gene ）与位点（locus ）  决定某一性状的DNA功能单位称为基因，它是一 段具有特定结构的连续的DNA序列。（估计人类 核基因有近十万个）  每个基因在染色体上都有特定的位置，即基因座 （locus ），又称为位点 2010-12-29 遗传数据基因定位的统计方法简介 6 多态性（polymorphism ）  基因的不同形式，如A和a，相互是等位基因 （alleles ）  具有相同等位基因的个体称为纯合子 （homozygote ）：如 aa  具有不同等位基因的个体称为杂合子 （heterozygote ）：如 Aa  等位基因的不同形式即为多态性现象 2010-12-29 遗传数据基因定位的统计方法简介 7 复等位现象 • 一个基因存在很多等位形式，称为复等位现象 （multiple allelism ）。 • 例如，人的血型——ABO血型。 • ABO血型由3个复等位基因决定。这3个复等位基 因是IA ；IB ；i ，它们组成6种基因型。但因IA 与IB A B 间表示共显性，而I 和I 对i都是显性，所以6种基 因型只显现4种表型 （phenotype ）。 2010-12-29 遗传数据基因定位的统计方法简介 8 A A A • I I 和I i 在表型上相同，都是A型 B B B • I I 和I i 在表型上相同，都是B型 • IAIB 杂合体中，IA 和IB 都是显性，表型是AB型 • ii 的表型是O型 表型（phenotype ）：表型是指可观察到的个体性 状，如身高，体重，血型，是否