猪传染性胃肠炎病毒N蛋白的二级结构和B细胞抗原表位的预测.pdf

第30卷第5期 家畜生态学报 V01．30No．5 Aeta AnimalisDomastici Sept．2009 2009年9月 Eeologiae 猪传染性胃肠炎病毒N蛋白的二级结构 和B细胞抗原表位的预测 姜宁朋1，孙健全2，黄庆华2，王可孙 [摘 要] 蛋白的表面可能性，最后结合吴玉章的方法综合分析预测B细胞抗原表位。结果显示柔性区 段，a一螺旋和8功}叠数量少且分散。N蛋白可能的B细胞抗原位点是N一端12～3l，154～ N蛋白的抗原优势表位。本研究为TGEV抗原优势表位的试验研究和反向疫苗的研制奠定 了基础。 [关键词]猪传染性胃肠炎病毒；二级结构；B细胞抗原表位 [中国分类号]$811．5 [文献标识码]A [文章编号]1004—5228【2009)05一0019—05 猪传染性胃肠炎(Transmissiblegastroenteritis of swine，TGE)是猪的一种高度接触性肠道传染 病，发病急、传播快，以引起7～10日龄以内仔猪呕 吐、严重腹泻和高死亡率(通常i00％)为特征，该病纤突(s)蛋白、小膜(sM)蛋白、膜(M)蛋白和核衣壳 最早发现于1933年的美国依利诺斯州，1946年 Doyle和Hutchings确定该病的病原为冠状病毒， 命名为猪传染性胃肠炎病毒[1]。近年来，随着分子 生物学的发展，对TGEV的结构蛋白、核酸结构、基 因表达方式及基因工程等方面的研究取得了较大的 码区为位于3 进展。 的280个核苷酸。研究表明，TGEV基因组具有很 TGEV病毒粒子的直径为90～200nm，呈圆高的重组率，这一现象类似于分节段的RNA病 形，其基因组为不分段的单股正链RNA，其57端 毒啪。 具有帽子结构，3’端具有poly(A)尾，基因组与核TGEV的N基因长1．7×103 bp，翻译产物 X 蛋白相结合，具有感染性。基因组全长约为2．85 为382个氨基酸残基，分子质量约为45kda，N蛋 104bp，分子质量为6×103ku，分为7个区，每个区 白的氨基酸序列保守性很强，它在病毒的致病性及 有一个或两个开放阅读框(ORFs)，基因组结构为病毒复制和转录过程中具有重要作用n]。这就为以 5’一20RF】a一0RFlb3／S—ORF3a—ORF3b—SM—M—N一 N蛋白作为该病的诊断提供了理论基础。TGEV [收稿日期]2009—03—30，修回日期：2009·07—29 [基金项目]山东省自然科学基金资助项目(Q2006D06)． [作者简介]姜宁朋(1980-)，男，山东潍坊人，助理研究员，硕士，研究方向：动物检疫与食品检验。 * [通讯作者] 万方数据 20 家畜生态学报 第30卷 抗原表位的研究是反向疫苗设计和免疫识别的基 1．2 N蛋白的二级结构预测 Chou—fasman 础，本文运用计算机技术和分子生物学软件对 运用 Garnier-Robson、 和 TGEV病毒N蛋白的二级结构和B细胞抗原表位Karplus-Schulz方法预测TGEVN蛋白的二级结 进行预测分析，以期为’FGE反向疫苗学的研究提 构。 1．3 TGEV 供理论依据。