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分子与诊断学整理【江大京江版】
原核生物基因组
原核生物主要包括、细菌、支原体、立克次体、衣原体、螺旋体、放线菌、蓝绿藻等
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有关质粒
按质粒的功能分类:
致育质粒?????? F质粒)编码性菌毛,介导细菌之间的接合传递;
耐药性质粒???? R质粒)?? 编码细菌对抗菌药物或重金属盐类的耐药性;
毒力质粒?????? Vi质粒)编码与该菌致病性有关的毒力因子;
细菌素质粒???????????? 编码细菌产生细菌素;
代谢质粒?????????????? 编码产生相关的代谢酶。
按复制机制分类:
1、严紧控制型
拷贝数少,一般10个,分子量大;
?调节因子是蛋白质,复制受限,受染色体DNA复制系统的控制;
?严谨控制机理(低拷贝原因),认为是该质粒可以产生阻遏蛋白,反馈抑制自身DNA合成。
2、松弛控制型
拷贝数多,10-200个,分子量小;
调节因子是RNA,复制不受染色体DNA复制系统限制
基因工程使用松弛型(高拷贝数) 质粒,以获得较多的基因产物。
性质:
1、转移性:可以通过转化、转导或接合作用而由一个细菌细胞转移到另一个细菌细胞中,使两个细胞都成为带有质粒的细胞;质粒转移时,它可以单独转移,也可以携带着染色体(片段)一起进行转移,所以它可成为基因工程的载体。
2、质粒具有选择性标记:质粒有抗药性基因、营养缺陷型基因、抗重金属盐基因等多种选择性标记;
3、质粒的不相容性:同一类群的不同质粒一般不能在同一菌株内稳定共存;
4、自主复制性:能独立于宿主染色体DNA外独立复制(但也必须在宿主细胞内才能复制);
质粒已成为分子克隆的有用工具,是目的DNA的载体。载体质粒大多是在天然质粒基础上经人工构建而成,
质粒的一些特点:
1、有限制性核酸内切酶单一切口,可用以重组外源DNA;
2、有筛选标记,如抗药基因等;
3、插入外源DNA后,仍能转化宿主细胞,并能复制。
质粒基因转移的方式: ??
1、接合作用?? 当细胞与细胞、或细菌通过菌毛相互接触时,质粒DNA从一个细胞(细菌)转移至另一细胞(细菌)的DNA转移称为接合作用
2、转化作用?? 通过自动获取或人为地供给外源DNA,使细胞或培养的受体细胞获得新的遗传表型,称为转化作用
3、转导作用? 当病毒从被感染的(供体)细胞释放出来、再次感染另一(受体)细胞时,发生在供体细胞与受体细胞之间的DNA转移及基因重组即为转导作用
4、转染作用?? 通过感染方式将外来 DNA 引入宿主细胞,并导致宿主细胞遗传性状改变的过程称为转染 (transfection) 。转染是转化的一种特殊形式。
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完整的病毒颗粒包括:衣壳 、基因组(DNA或RNA) 、被膜、病毒颗粒中的其他内容物
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病毒分段基因组:流感病毒属分段RNA病毒
意义:
a)降低包装压力
b)降低了造成断裂的可能性,提高编码能力?
c) 有分段基因组的病毒一般感染效率较低,只有全部基因组核酸片段存在时,病毒才具有感染能力。植物病毒
d) 由于分段基因组易发生重组,故病毒容易变异。
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病毒基因组特点:
1、5‘的帽子和3’的poly(A)尾结构
2、末端重复序列结果:粘性末段、正/反向互补序列、长末端重复序列;
3、 高效基因组:排列紧密很少间隔区,不仅非编码序列少,而且有重叠基因的存在;
4、分段基因组:易重组,是病毒易变异的原因。
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染色体的包装:
(1)染色体的一级结构—核小体
(2)染色体的二级结构—螺线管
(3)染色体的三级结构—超螺线管
(4)染色体的四级结构—染色单体
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真核生物染色体基因组一般特征
1、真核生物的基因组比较庞大;
2、线性双链DNA和二倍体;
3、真核细胞基因转录产物为单顺反子。
4、存在重复序列,重复次数可达百万次 以上
5、基因是不连续的(断裂基因)
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重复序列:指多拷贝的相同或近似序列的DNA片段
一、高度重复序列 ,
按其结构特点分为三种 :
1、反向重复序列
2、卫星DNA 由于这类序列的碱基组成不同于其他部份,可用等密度梯度离心法将其与主体DNA 分开,因而称为卫星DNA (或随体DNA)
3、较复杂的重复单位组成的重复顺序
二、中度重复顺序 :
依据重复顺序的长度,中度重复顺序可分为:短散布元件和长散布元件??
Alu 家族:是哺乳动物基因组中含量最丰富的一种中度重复顺序家族(短分散元件),Alu家族每个成员的长度约300bp ,每个单位长度中有一个限制性内切酶AluⅠ的切点(AG↓CT),Alu可将其切成长130和170bp的两段,因而定名为Alu序列(或Alu家族)
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线粒体DNA的遗传特性 : 母系遗传、突变率高、异质性、阈值效应、半自助复制与协同效应
阈值效应:mtDNA突变导致氧化磷酸化水平降低,当突变的mtDNA达到一定比例时,使得线粒体总的能量供应降低到维持组织正常功能所
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