利用EST-SSR标记研究黄金茶群体遗传多样性和遗传分化.pdfVIP

茶 叶 科 学 2009 ，29 （3 ）：236~242 Journal of Tea Science 利用 EST-SSR 标记研究黄金茶群体遗传多样性及遗传分 化 * 杨阳P P ，刘振，赵洋，梁国强，赵熙 (湖南省茶叶研究所，湖南 长沙 410215) 摘要：利用 19 对茶树EST-SSR 引物对黄金茶群体的 38 个单株进行了遗传多样性和亲缘关系分析。19 对引物 共检测到等位位点 37 个，每个引物 1~3 个，平均 1.95 个；期望杂合度(HBeB)在 0.03~0.65 之间，平均值 0.32 ； 观测杂合度(HBoB)在 0~0.97 之间，平均值 0.33 ；群体内的Shannon指数 0.55 。以上结果均说明黄金茶群体的遗传 多样性较低。基于EST-SSR数据以SAHN邻接法对供试种质资源进行UPGMA遗传相似性聚类，并绘制树状聚 类图，按相似系数 0.77 可将参试的 38 份种质资源分为六大类。根据不同单株间的相似系数可为黄金茶群体的 遗传改良提供一定参考。同时，AMOVA 分析表明，黄金茶群体的遗传变异 21.77%发生在种群间，78.23%发 生于单株间，不同区域的种群间基因流为 1.80，这可以为黄金茶群体的保护提供一定理论依据。 关键词：茶树；黄金茶群体；EST-SSR ；遗传多样性；亲缘关系 中图分类号：S571.1 ；Q311 文献标识码：A 文章编号：1000-369X （2009 ）03-236-07 Genetic Diversity and Relationship of Huangjincha Cultivar Based on EST-SSR Markers * YANG YangP P , LIU Zhen, ZHAO Yang, LIANG Guo-qiang, ZHAO Xi （Hunan Tea Research Institute, Changsha, 410125, China ） Abstract: The 19 pairs of EST-SSR primers were used to analyze the genetic polymorphism and genetic relationship of 38 Huangjincha individuals. Totally 37 alleles were amplified using 19 EST-SSR primers, the number of alleles per primer ranged from 1 to 3, on average of 1.95. The expected heterozygosity (HBeB) varied from 0.03 to 0.65, and the observed heterozygosity (HBoB) ranged from 0 to 0.97, on average of 0.32 and 0.33, respectively. The Shannon index of the Huangjincha was 0.55. All of the results showed that the genetic polymorphism of Huangjincha was relatively poor. The 38 individuals were classified into 6 groups based on the UPGMA method with the similarity coefficient at 0.77. The results of the similarity coefficient among different individuals can give some implications to the genetic improvement of Huangjinc