禽流与感NS1与其抑制剂相互作用模式的分析.pptVIP

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2017-05-31 发布于浙江
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禽流与感NS1与其抑制剂相互作用模式的分析

禽流感NS1与其抑制剂相互作用模式的分析报告人：郭莹莹导师：王靖飞副研究员中国农业科学院哈尔滨兽医研究所 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 研究背景禽流感是一种严重危害人类以及畜禽健康的致命性病毒，每隔十年左右就会流行一次目前治疗禽流感药物主要作用靶点有神经氨酸酶和M2离子通道。据报道以血凝素和RNA聚合酶为靶点也发现了一些活性化合物 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 研究背景 NS1药物靶点： NS1蛋白根据其功能被定义为两个区域：RNA结合域和效应区。RNA结合域（RNA-binding domain，RBD）在靠近dsRNA结合面有一个口袋，这个口袋已经被证明可以作为抗病毒药物设计的靶点优点：不易产生耐药性 PDB ID：2zko Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 研究背景 NS1抑制剂的研究现状： Maroto等以这个结合口袋为靶点建立了一种高通量筛选方法用于寻找抗病毒药物，并成功筛选出3个有活性的抑制剂（结构未报导） Basu等也通过一种基于酵母的实验成功筛选出四个具有生物活性的抑制剂。但是由于缺乏三维结构数据资料，抑制剂的结合模式还不清楚另外一些利用虚拟筛选方法寻找先导化合物的研究也已经开展 Maroto M, Fernandez Y, Ortin J, Pelaez F, Cabello MA. Development of an HTS assay for the search of anti-influenza agents targeting the interaction of viral RNA with the NS1 protein. J Biomol Screen. 2008; 13: 581-90. Basu D, Walkiewicz MP, Frieman M, Baric RS, Auble DT, Engel DA. Novel influenza virus NS1 antagonists block replication and restore innate immune function. J Virol. 2009; 83: 1881-91. Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 研究的目的意义由于NS1抑制剂的作用模式并不清晰，阻碍了采用计算机辅助药物设计的手段发现新的先导化合物。本研究在分子结构水平对已知的NS1抑制剂作用模式进行研究，为设计、筛选新的药物提供了重要的参考 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 分子动力学模拟能量最小化实验材料与方法结果分析：抑制剂结合能计算抑制剂与关键氨基酸相互作用能计算 LibDock Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 实验材料与方法抑制剂结构及其搭建 Basu D, Walkiewicz MP, Frieman M, Baric RS, Auble DT, Engel DA. Novel influenza virus NS1 antagonists block replication and restore innate immune function. J Virol. 2009; 83: 1881-91 DS2.1构建，加电荷，加力